Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1T1

Ap3b1, AP-3 complex subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b1Q9Z1T1 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ap3b1Q9Z1T1 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ap3b1Q9Z1T1 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ap3b1Q9Z1T1 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ap3b1Q9Z1T1 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ap3b1Q9Z1T1 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ap3b1Q9Z1T1 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ap3b1Q9Z1T1 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ap3b1Q9Z1T1 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ap3b1Q9Z1T1 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ap3b1Q9Z1T1 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ap3b1Q9Z1T1 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ap3b1Q9Z1T1 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ap3b1Q9Z1T1 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ap3b1Q9Z1T1 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ap3b1Q9Z1T1 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ap3b1Q9Z1T1 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ap3b1Q9Z1T1 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ap3b1Q9Z1T1 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ap3b1Q9Z1T1 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ap3b1Q9Z1T1 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ap3b1Q9Z1T1 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ap3b1Q9Z1T1 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ap3b1Q9Z1T1 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ap3b1Q9Z1T1 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ap3b1Q9Z1T1 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ap3b1Q9Z1T1 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ap3b1Q9Z1T1 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ap3b1Q9Z1T1 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ap3b1Q9Z1T1 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ap3b1Q9Z1T1 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ap3b1Q9Z1T1 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ap3b1Q9Z1T1 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ap3b1Q9Z1T1 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Ap3b1Q9Z1T1 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ap3b1Q9Z1T1 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ap3b1Q9Z1T1 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ap3b1Q9Z1T1 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ap3b1Q9Z1T1 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ap3b1Q9Z1T1 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ap3b1Q9Z1T1 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ap3b1Q9Z1T1 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ap3b1Q9Z1T1 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ap3b1Q9Z1T1 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ap3b1Q9Z1T1 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ap3b1Q9Z1T1 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ap3b1Q9Z1T1 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ap3b1Q9Z1T1 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ap3b1Q9Z1T1 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ap3b1Q9Z1T1 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ap3b1Q9Z1T1 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ap3b1Q9Z1T1 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ap3b1Q9Z1T1 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ap3b1Q9Z1T1 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ap3b1Q9Z1T1 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ap3b1Q9Z1T1 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ap3b1Q9Z1T1 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ap3b1Q9Z1T1 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ap3b1Q9Z1T1 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ap3b1Q9Z1T1 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ap3b1Q9Z1T1 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ap3b1Q9Z1T1 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ap3b1Q9Z1T1 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ap3b1Q9Z1T1 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ap3b1Q9Z1T1 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ap3b1Q9Z1T1 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ap3b1Q9Z1T1 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ap3b1Q9Z1T1 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ap3b1Q9Z1T1 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ap3b1Q9Z1T1 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ap3b1Q9Z1T1 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ap3b1Q9Z1T1 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ap3b1Q9Z1T1 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ap3b1Q9Z1T1 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ap3b1Q9Z1T1 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ap3b1Q9Z1T1 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ap3b1Q9Z1T1 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ap3b1Q9Z1T1 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ap3b1Q9Z1T1 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ap3b1Q9Z1T1 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ap3b1Q9Z1T1 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ap3b1Q9Z1T1 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ap3b1Q9Z1T1 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ap3b1Q9Z1T1 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ap3b1Q9Z1T1 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ap3b1Q9Z1T1 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ap3b1Q9Z1T1 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ap3b1Q9Z1T1 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ap3b1Q9Z1T1 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ap3b1Q9Z1T1 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ap3b1Q9Z1T1 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ap3b1Q9Z1T1 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ap3b1Q9Z1T1 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ap3b1Q9Z1T1 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ap3b1Q9Z1T1 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ap3b1Q9Z1T1 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ap3b1Q9Z1T1 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ap3b1Q9Z1T1 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms