Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1P4

Lgr5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr5Q9Z1P4 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lgr5Q9Z1P4 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lgr5Q9Z1P4 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Lgr5Q9Z1P4 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lgr5Q9Z1P4 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lgr5Q9Z1P4 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lgr5Q9Z1P4 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Lgr5Q9Z1P4 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Lgr5Q9Z1P4 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Lgr5Q9Z1P4 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Lgr5Q9Z1P4 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Lgr5Q9Z1P4 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Lgr5Q9Z1P4 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lgr5Q9Z1P4 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lgr5Q9Z1P4 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lgr5Q9Z1P4 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lgr5Q9Z1P4 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lgr5Q9Z1P4 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lgr5Q9Z1P4 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lgr5Q9Z1P4 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lgr5Q9Z1P4 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lgr5Q9Z1P4 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lgr5Q9Z1P4 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lgr5Q9Z1P4 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lgr5Q9Z1P4 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lgr5Q9Z1P4 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lgr5Q9Z1P4 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lgr5Q9Z1P4 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lgr5Q9Z1P4 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lgr5Q9Z1P4 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lgr5Q9Z1P4 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Lgr5Q9Z1P4 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lgr5Q9Z1P4 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lgr5Q9Z1P4 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lgr5Q9Z1P4 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lgr5Q9Z1P4 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lgr5Q9Z1P4 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lgr5Q9Z1P4 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lgr5Q9Z1P4 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lgr5Q9Z1P4 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lgr5Q9Z1P4 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Lgr5Q9Z1P4 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lgr5Q9Z1P4 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lgr5Q9Z1P4 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lgr5Q9Z1P4 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lgr5Q9Z1P4 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lgr5Q9Z1P4 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lgr5Q9Z1P4 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lgr5Q9Z1P4 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lgr5Q9Z1P4 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lgr5Q9Z1P4 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lgr5Q9Z1P4 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lgr5Q9Z1P4 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lgr5Q9Z1P4 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lgr5Q9Z1P4 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lgr5Q9Z1P4 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lgr5Q9Z1P4 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lgr5Q9Z1P4 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lgr5Q9Z1P4 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lgr5Q9Z1P4 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lgr5Q9Z1P4 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Lgr5Q9Z1P4 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Lgr5Q9Z1P4 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lgr5Q9Z1P4 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lgr5Q9Z1P4 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Lgr5Q9Z1P4 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Lgr5Q9Z1P4 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lgr5Q9Z1P4 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Lgr5Q9Z1P4 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Lgr5Q9Z1P4 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Lgr5Q9Z1P4 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lgr5Q9Z1P4 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lgr5Q9Z1P4 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lgr5Q9Z1P4 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lgr5Q9Z1P4 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lgr5Q9Z1P4 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lgr5Q9Z1P4 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lgr5Q9Z1P4 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Lgr5Q9Z1P4 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Lgr5Q9Z1P4 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Lgr5Q9Z1P4 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lgr5Q9Z1P4 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Lgr5Q9Z1P4 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lgr5Q9Z1P4 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lgr5Q9Z1P4 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lgr5Q9Z1P4 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lgr5Q9Z1P4 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lgr5Q9Z1P4 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lgr5Q9Z1P4 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lgr5Q9Z1P4 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lgr5Q9Z1P4 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Lgr5Q9Z1P4 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lgr5Q9Z1P4 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lgr5Q9Z1P4 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lgr5Q9Z1P4 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Lgr5Q9Z1P4 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Lgr5Q9Z1P4 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lgr5Q9Z1P4 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lgr5Q9Z1P4 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lgr5Q9Z1P4 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms