Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1N6

Sfrp4, Secreted frizzled-related sequence protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfrp4Q9Z1N6 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Sfrp4Q9Z1N6 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Sfrp4Q9Z1N6 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Sfrp4Q9Z1N6 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Sfrp4Q9Z1N6 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sfrp4Q9Z1N6 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sfrp4Q9Z1N6 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sfrp4Q9Z1N6 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.5 ms