Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUU8

Tnip1, TNFAIP3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 647 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnip1Q9WUU8 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnip1Q9WUU8 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnip1Q9WUU8 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnip1Q9WUU8 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnip1Q9WUU8 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnip1Q9WUU8 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnip1Q9WUU8 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnip1Q9WUU8 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnip1Q9WUU8 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnip1Q9WUU8 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnip1Q9WUU8 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnip1Q9WUU8 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnip1Q9WUU8 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnip1Q9WUU8 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnip1Q9WUU8 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnip1Q9WUU8 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnip1Q9WUU8 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnip1Q9WUU8 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnip1Q9WUU8 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnip1Q9WUU8 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnip1Q9WUU8 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnip1Q9WUU8 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnip1Q9WUU8 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnip1Q9WUU8 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnip1Q9WUU8 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnip1Q9WUU8 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnip1Q9WUU8 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnip1Q9WUU8 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnip1Q9WUU8 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnip1Q9WUU8 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnip1Q9WUU8 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnip1Q9WUU8 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnip1Q9WUU8 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnip1Q9WUU8 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnip1Q9WUU8 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnip1Q9WUU8 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnip1Q9WUU8 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnip1Q9WUU8 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnip1Q9WUU8 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnip1Q9WUU8 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnip1Q9WUU8 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnip1Q9WUU8 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnip1Q9WUU8 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnip1Q9WUU8 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnip1Q9WUU8 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnip1Q9WUU8 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnip1Q9WUU8 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnip1Q9WUU8 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnip1Q9WUU8 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnip1Q9WUU8 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnip1Q9WUU8 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnip1Q9WUU8 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnip1Q9WUU8 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnip1Q9WUU8 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnip1Q9WUU8 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnip1Q9WUU8 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnip1Q9WUU8 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnip1Q9WUU8 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnip1Q9WUU8 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnip1Q9WUU8 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnip1Q9WUU8 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnip1Q9WUU8 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnip1Q9WUU8 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnip1Q9WUU8 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnip1Q9WUU8 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnip1Q9WUU8 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnip1Q9WUU8 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnip1Q9WUU8 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnip1Q9WUU8 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnip1Q9WUU8 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnip1Q9WUU8 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnip1Q9WUU8 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnip1Q9WUU8 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnip1Q9WUU8 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnip1Q9WUU8 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnip1Q9WUU8 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnip1Q9WUU8 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnip1Q9WUU8 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnip1Q9WUU8 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnip1Q9WUU8 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnip1Q9WUU8 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnip1Q9WUU8 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnip1Q9WUU8 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnip1Q9WUU8 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnip1Q9WUU8 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnip1Q9WUU8 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnip1Q9WUU8 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnip1Q9WUU8 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnip1Q9WUU8 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnip1Q9WUU8 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnip1Q9WUU8 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnip1Q9WUU8 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnip1Q9WUU8 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnip1Q9WUU8 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnip1Q9WUU8 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnip1Q9WUU8 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnip1Q9WUU8 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnip1Q9WUU8 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnip1Q9WUU8 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnip1Q9WUU8 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms