Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU28

Pfdn5, Prefoldin subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn5Q9WU28 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pfdn5Q9WU28 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pfdn5Q9WU28 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pfdn5Q9WU28 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pfdn5Q9WU28 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pfdn5Q9WU28 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pfdn5Q9WU28 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pfdn5Q9WU28 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pfdn5Q9WU28 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pfdn5Q9WU28 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pfdn5Q9WU28 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pfdn5Q9WU28 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pfdn5Q9WU28 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pfdn5Q9WU28 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pfdn5Q9WU28 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pfdn5Q9WU28 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pfdn5Q9WU28 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pfdn5Q9WU28 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pfdn5Q9WU28 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pfdn5Q9WU28 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pfdn5Q9WU28 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pfdn5Q9WU28 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pfdn5Q9WU28 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pfdn5Q9WU28 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pfdn5Q9WU28 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pfdn5Q9WU28 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Pfdn5Q9WU28 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Pfdn5Q9WU28 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pfdn5Q9WU28 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pfdn5Q9WU28 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pfdn5Q9WU28 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pfdn5Q9WU28 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pfdn5Q9WU28 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pfdn5Q9WU28 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pfdn5Q9WU28 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pfdn5Q9WU28 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pfdn5Q9WU28 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pfdn5Q9WU28 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pfdn5Q9WU28 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pfdn5Q9WU28 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pfdn5Q9WU28 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pfdn5Q9WU28 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Pfdn5Q9WU28 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pfdn5Q9WU28 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pfdn5Q9WU28 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Pfdn5Q9WU28 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pfdn5Q9WU28 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pfdn5Q9WU28 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pfdn5Q9WU28 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pfdn5Q9WU28 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pfdn5Q9WU28 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pfdn5Q9WU28 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pfdn5Q9WU28 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pfdn5Q9WU28 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pfdn5Q9WU28 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pfdn5Q9WU28 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pfdn5Q9WU28 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pfdn5Q9WU28 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pfdn5Q9WU28 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pfdn5Q9WU28 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pfdn5Q9WU28 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pfdn5Q9WU28 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pfdn5Q9WU28 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Pfdn5Q9WU28 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Pfdn5Q9WU28 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pfdn5Q9WU28 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pfdn5Q9WU28 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pfdn5Q9WU28 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pfdn5Q9WU28 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pfdn5Q9WU28 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pfdn5Q9WU28 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pfdn5Q9WU28 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pfdn5Q9WU28 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pfdn5Q9WU28 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pfdn5Q9WU28 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Pfdn5Q9WU28 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pfdn5Q9WU28 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pfdn5Q9WU28 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pfdn5Q9WU28 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pfdn5Q9WU28 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pfdn5Q9WU28 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pfdn5Q9WU28 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pfdn5Q9WU28 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pfdn5Q9WU28 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pfdn5Q9WU28 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pfdn5Q9WU28 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pfdn5Q9WU28 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pfdn5Q9WU28 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pfdn5Q9WU28 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pfdn5Q9WU28 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pfdn5Q9WU28 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pfdn5Q9WU28 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pfdn5Q9WU28 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pfdn5Q9WU28 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pfdn5Q9WU28 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pfdn5Q9WU28 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pfdn5Q9WU28 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pfdn5Q9WU28 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Pfdn5Q9WU28 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pfdn5Q9WU28 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms