Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P1

Psmb3, Proteasome subunit beta type-3, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb3Q9R1P1 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms