Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E1

Plod3, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 3, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod3Q9R0E1 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Plod3Q9R0E1 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Plod3Q9R0E1 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Plod3Q9R0E1 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Plod3Q9R0E1 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Plod3Q9R0E1 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Plod3Q9R0E1 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Plod3Q9R0E1 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Plod3Q9R0E1 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Plod3Q9R0E1 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Plod3Q9R0E1 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Plod3Q9R0E1 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Plod3Q9R0E1 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Plod3Q9R0E1 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Plod3Q9R0E1 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Plod3Q9R0E1 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Plod3Q9R0E1 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Plod3Q9R0E1 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Plod3Q9R0E1 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Plod3Q9R0E1 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Plod3Q9R0E1 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Plod3Q9R0E1 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Plod3Q9R0E1 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Plod3Q9R0E1 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Plod3Q9R0E1 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Plod3Q9R0E1 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Plod3Q9R0E1 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Plod3Q9R0E1 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Plod3Q9R0E1 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Plod3Q9R0E1 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Plod3Q9R0E1 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Plod3Q9R0E1 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Plod3Q9R0E1 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Plod3Q9R0E1 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Plod3Q9R0E1 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Plod3Q9R0E1 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Plod3Q9R0E1 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Plod3Q9R0E1 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Plod3Q9R0E1 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Plod3Q9R0E1 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Plod3Q9R0E1 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Plod3Q9R0E1 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Plod3Q9R0E1 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Plod3Q9R0E1 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Plod3Q9R0E1 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Plod3Q9R0E1 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Plod3Q9R0E1 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Plod3Q9R0E1 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Plod3Q9R0E1 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Plod3Q9R0E1 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Plod3Q9R0E1 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Plod3Q9R0E1 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Plod3Q9R0E1 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Plod3Q9R0E1 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Plod3Q9R0E1 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Plod3Q9R0E1 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Plod3Q9R0E1 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Plod3Q9R0E1 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Plod3Q9R0E1 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Plod3Q9R0E1 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Plod3Q9R0E1 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Plod3Q9R0E1 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Plod3Q9R0E1 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Plod3Q9R0E1 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Plod3Q9R0E1 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Plod3Q9R0E1 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Plod3Q9R0E1 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Plod3Q9R0E1 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Plod3Q9R0E1 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Plod3Q9R0E1 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Plod3Q9R0E1 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Plod3Q9R0E1 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Plod3Q9R0E1 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Plod3Q9R0E1 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Plod3Q9R0E1 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Plod3Q9R0E1 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Plod3Q9R0E1 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Plod3Q9R0E1 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Plod3Q9R0E1 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Plod3Q9R0E1 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Plod3Q9R0E1 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Plod3Q9R0E1 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Plod3Q9R0E1 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Plod3Q9R0E1 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Plod3Q9R0E1 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Plod3Q9R0E1 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Plod3Q9R0E1 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Plod3Q9R0E1 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Plod3Q9R0E1 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Plod3Q9R0E1 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Plod3Q9R0E1 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Plod3Q9R0E1 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Plod3Q9R0E1 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Plod3Q9R0E1 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Plod3Q9R0E1 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Plod3Q9R0E1 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Plod3Q9R0E1 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Plod3Q9R0E1 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Plod3Q9R0E1 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Plod3Q9R0E1 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms