Protein–RNA interactions for Protein: Q9R049

Amfr, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmfrQ9R049 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AmfrQ9R049 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AmfrQ9R049 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
AmfrQ9R049 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AmfrQ9R049 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AmfrQ9R049 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AmfrQ9R049 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AmfrQ9R049 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AmfrQ9R049 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
AmfrQ9R049 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
AmfrQ9R049 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
AmfrQ9R049 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AmfrQ9R049 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AmfrQ9R049 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AmfrQ9R049 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AmfrQ9R049 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AmfrQ9R049 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AmfrQ9R049 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AmfrQ9R049 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AmfrQ9R049 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AmfrQ9R049 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AmfrQ9R049 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AmfrQ9R049 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AmfrQ9R049 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
AmfrQ9R049 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AmfrQ9R049 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
AmfrQ9R049 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
AmfrQ9R049 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AmfrQ9R049 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AmfrQ9R049 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AmfrQ9R049 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
AmfrQ9R049 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
AmfrQ9R049 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
AmfrQ9R049 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
AmfrQ9R049 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
AmfrQ9R049 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
AmfrQ9R049 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
AmfrQ9R049 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
AmfrQ9R049 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
AmfrQ9R049 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
AmfrQ9R049 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
AmfrQ9R049 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
AmfrQ9R049 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
AmfrQ9R049 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
AmfrQ9R049 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AmfrQ9R049 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AmfrQ9R049 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
AmfrQ9R049 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AmfrQ9R049 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AmfrQ9R049 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AmfrQ9R049 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AmfrQ9R049 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AmfrQ9R049 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
AmfrQ9R049 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AmfrQ9R049 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AmfrQ9R049 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AmfrQ9R049 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AmfrQ9R049 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AmfrQ9R049 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AmfrQ9R049 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AmfrQ9R049 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AmfrQ9R049 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AmfrQ9R049 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AmfrQ9R049 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AmfrQ9R049 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AmfrQ9R049 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AmfrQ9R049 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AmfrQ9R049 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AmfrQ9R049 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AmfrQ9R049 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AmfrQ9R049 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AmfrQ9R049 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AmfrQ9R049 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AmfrQ9R049 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AmfrQ9R049 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AmfrQ9R049 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AmfrQ9R049 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AmfrQ9R049 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AmfrQ9R049 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AmfrQ9R049 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AmfrQ9R049 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AmfrQ9R049 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AmfrQ9R049 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AmfrQ9R049 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
AmfrQ9R049 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AmfrQ9R049 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AmfrQ9R049 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AmfrQ9R049 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AmfrQ9R049 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AmfrQ9R049 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
AmfrQ9R049 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AmfrQ9R049 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AmfrQ9R049 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AmfrQ9R049 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AmfrQ9R049 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AmfrQ9R049 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AmfrQ9R049 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AmfrQ9R049 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
AmfrQ9R049 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AmfrQ9R049 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.1 ms