Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ47

Tnnt3, Troponin T, fast skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt3Q9QZ47 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnnt3Q9QZ47 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnnt3Q9QZ47 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnnt3Q9QZ47 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnnt3Q9QZ47 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnnt3Q9QZ47 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnnt3Q9QZ47 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnnt3Q9QZ47 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnnt3Q9QZ47 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnnt3Q9QZ47 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnnt3Q9QZ47 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnnt3Q9QZ47 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnnt3Q9QZ47 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnnt3Q9QZ47 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnnt3Q9QZ47 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnnt3Q9QZ47 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnnt3Q9QZ47 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnnt3Q9QZ47 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnnt3Q9QZ47 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnnt3Q9QZ47 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnnt3Q9QZ47 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnnt3Q9QZ47 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnnt3Q9QZ47 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnnt3Q9QZ47 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnnt3Q9QZ47 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnnt3Q9QZ47 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnnt3Q9QZ47 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnnt3Q9QZ47 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnnt3Q9QZ47 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnnt3Q9QZ47 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnnt3Q9QZ47 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnnt3Q9QZ47 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnnt3Q9QZ47 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnnt3Q9QZ47 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnnt3Q9QZ47 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnnt3Q9QZ47 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnnt3Q9QZ47 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnnt3Q9QZ47 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnnt3Q9QZ47 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnnt3Q9QZ47 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnnt3Q9QZ47 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnnt3Q9QZ47 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnnt3Q9QZ47 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnnt3Q9QZ47 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnnt3Q9QZ47 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnnt3Q9QZ47 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnnt3Q9QZ47 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnnt3Q9QZ47 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnnt3Q9QZ47 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnnt3Q9QZ47 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnnt3Q9QZ47 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnnt3Q9QZ47 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnnt3Q9QZ47 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnnt3Q9QZ47 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnnt3Q9QZ47 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnnt3Q9QZ47 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnnt3Q9QZ47 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnnt3Q9QZ47 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnnt3Q9QZ47 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnnt3Q9QZ47 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnnt3Q9QZ47 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnnt3Q9QZ47 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnnt3Q9QZ47 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnnt3Q9QZ47 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnnt3Q9QZ47 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnnt3Q9QZ47 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnnt3Q9QZ47 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tnnt3Q9QZ47 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tnnt3Q9QZ47 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tnnt3Q9QZ47 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tnnt3Q9QZ47 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tnnt3Q9QZ47 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tnnt3Q9QZ47 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Tnnt3Q9QZ47 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tnnt3Q9QZ47 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tnnt3Q9QZ47 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tnnt3Q9QZ47 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tnnt3Q9QZ47 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tnnt3Q9QZ47 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Tnnt3Q9QZ47 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Tnnt3Q9QZ47 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Tnnt3Q9QZ47 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tnnt3Q9QZ47 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tnnt3Q9QZ47 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tnnt3Q9QZ47 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tnnt3Q9QZ47 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tnnt3Q9QZ47 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tnnt3Q9QZ47 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tnnt3Q9QZ47 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tnnt3Q9QZ47 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tnnt3Q9QZ47 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Tnnt3Q9QZ47 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Tnnt3Q9QZ47 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tnnt3Q9QZ47 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnnt3Q9QZ47 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnnt3Q9QZ47 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnnt3Q9QZ47 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnnt3Q9QZ47 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnnt3Q9QZ47 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnnt3Q9QZ47 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms