Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ7

Nr2e3, Photoreceptor-specific nuclear receptor, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2e3Q9QXZ7 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nr2e3Q9QXZ7 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nr2e3Q9QXZ7 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nr2e3Q9QXZ7 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nr2e3Q9QXZ7 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nr2e3Q9QXZ7 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nr2e3Q9QXZ7 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nr2e3Q9QXZ7 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nr2e3Q9QXZ7 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nr2e3Q9QXZ7 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Nr2e3Q9QXZ7 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Nr2e3Q9QXZ7 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nr2e3Q9QXZ7 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nr2e3Q9QXZ7 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nr2e3Q9QXZ7 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nr2e3Q9QXZ7 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nr2e3Q9QXZ7 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nr2e3Q9QXZ7 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nr2e3Q9QXZ7 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Nr2e3Q9QXZ7 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nr2e3Q9QXZ7 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nr2e3Q9QXZ7 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nr2e3Q9QXZ7 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nr2e3Q9QXZ7 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nr2e3Q9QXZ7 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nr2e3Q9QXZ7 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nr2e3Q9QXZ7 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nr2e3Q9QXZ7 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms