Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rabgef1Q9JM13 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rabgef1Q9JM13 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rabgef1Q9JM13 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rabgef1Q9JM13 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rabgef1Q9JM13 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rabgef1Q9JM13 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rabgef1Q9JM13 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rabgef1Q9JM13 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rabgef1Q9JM13 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rabgef1Q9JM13 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rabgef1Q9JM13 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rabgef1Q9JM13 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rabgef1Q9JM13 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rabgef1Q9JM13 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rabgef1Q9JM13 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rabgef1Q9JM13 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rabgef1Q9JM13 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Rabgef1Q9JM13 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Rabgef1Q9JM13 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rabgef1Q9JM13 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rabgef1Q9JM13 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rabgef1Q9JM13 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Rabgef1Q9JM13 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rabgef1Q9JM13 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Rabgef1Q9JM13 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rabgef1Q9JM13 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rabgef1Q9JM13 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rabgef1Q9JM13 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rabgef1Q9JM13 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rabgef1Q9JM13 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rabgef1Q9JM13 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Rabgef1Q9JM13 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rabgef1Q9JM13 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rabgef1Q9JM13 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rabgef1Q9JM13 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rabgef1Q9JM13 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rabgef1Q9JM13 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rabgef1Q9JM13 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rabgef1Q9JM13 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rabgef1Q9JM13 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rabgef1Q9JM13 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rabgef1Q9JM13 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rabgef1Q9JM13 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rabgef1Q9JM13 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Rabgef1Q9JM13 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rabgef1Q9JM13 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rabgef1Q9JM13 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rabgef1Q9JM13 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rabgef1Q9JM13 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rabgef1Q9JM13 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rabgef1Q9JM13 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rabgef1Q9JM13 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rabgef1Q9JM13 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rabgef1Q9JM13 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Rabgef1Q9JM13 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Rabgef1Q9JM13 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rabgef1Q9JM13 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rabgef1Q9JM13 mt-Rnr1-201ENSMUST00000082388 955 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Rabgef1Q9JM13 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rabgef1Q9JM13 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rabgef1Q9JM13 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rabgef1Q9JM13 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rabgef1Q9JM13 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Rabgef1Q9JM13 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rabgef1Q9JM13 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rabgef1Q9JM13 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rabgef1Q9JM13 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rabgef1Q9JM13 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rabgef1Q9JM13 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rabgef1Q9JM13 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rabgef1Q9JM13 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rabgef1Q9JM13 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rabgef1Q9JM13 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rabgef1Q9JM13 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rabgef1Q9JM13 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rabgef1Q9JM13 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rabgef1Q9JM13 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rabgef1Q9JM13 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rabgef1Q9JM13 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rabgef1Q9JM13 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rabgef1Q9JM13 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rabgef1Q9JM13 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rabgef1Q9JM13 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rabgef1Q9JM13 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Rabgef1Q9JM13 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rabgef1Q9JM13 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rabgef1Q9JM13 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Rabgef1Q9JM13 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rabgef1Q9JM13 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rabgef1Q9JM13 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rabgef1Q9JM13 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rabgef1Q9JM13 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rabgef1Q9JM13 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rabgef1Q9JM13 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rabgef1Q9JM13 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rabgef1Q9JM13 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rabgef1Q9JM13 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rabgef1Q9JM13 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rabgef1Q9JM13 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
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