Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL56

Gde1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gde1Q9JL56 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gde1Q9JL56 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Gde1Q9JL56 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Gde1Q9JL56 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Gde1Q9JL56 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Gde1Q9JL56 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gde1Q9JL56 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Gde1Q9JL56 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gde1Q9JL56 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gde1Q9JL56 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Gde1Q9JL56 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gde1Q9JL56 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gde1Q9JL56 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gde1Q9JL56 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gde1Q9JL56 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gde1Q9JL56 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gde1Q9JL56 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gde1Q9JL56 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gde1Q9JL56 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gde1Q9JL56 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gde1Q9JL56 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gde1Q9JL56 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Gde1Q9JL56 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gde1Q9JL56 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gde1Q9JL56 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gde1Q9JL56 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gde1Q9JL56 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gde1Q9JL56 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gde1Q9JL56 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gde1Q9JL56 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gde1Q9JL56 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gde1Q9JL56 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gde1Q9JL56 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Gde1Q9JL56 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gde1Q9JL56 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gde1Q9JL56 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Gde1Q9JL56 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gde1Q9JL56 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Gde1Q9JL56 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gde1Q9JL56 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gde1Q9JL56 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gde1Q9JL56 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gde1Q9JL56 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Gde1Q9JL56 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gde1Q9JL56 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gde1Q9JL56 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gde1Q9JL56 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gde1Q9JL56 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gde1Q9JL56 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gde1Q9JL56 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gde1Q9JL56 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gde1Q9JL56 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
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Gde1Q9JL56 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gde1Q9JL56 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gde1Q9JL56 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gde1Q9JL56 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gde1Q9JL56 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gde1Q9JL56 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gde1Q9JL56 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gde1Q9JL56 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gde1Q9JL56 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gde1Q9JL56 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gde1Q9JL56 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
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Gde1Q9JL56 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gde1Q9JL56 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gde1Q9JL56 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gde1Q9JL56 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gde1Q9JL56 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gde1Q9JL56 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gde1Q9JL56 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gde1Q9JL56 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gde1Q9JL56 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gde1Q9JL56 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gde1Q9JL56 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gde1Q9JL56 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gde1Q9JL56 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gde1Q9JL56 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gde1Q9JL56 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gde1Q9JL56 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gde1Q9JL56 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gde1Q9JL56 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gde1Q9JL56 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gde1Q9JL56 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gde1Q9JL56 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Gde1Q9JL56 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gde1Q9JL56 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gde1Q9JL56 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gde1Q9JL56 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gde1Q9JL56 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gde1Q9JL56 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms