Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS4

Ldb3, LIM domain-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb3Q9JKS4 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ldb3Q9JKS4 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ldb3Q9JKS4 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ldb3Q9JKS4 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Ldb3Q9JKS4 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ldb3Q9JKS4 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ldb3Q9JKS4 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ldb3Q9JKS4 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ldb3Q9JKS4 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ldb3Q9JKS4 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ldb3Q9JKS4 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ldb3Q9JKS4 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ldb3Q9JKS4 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ldb3Q9JKS4 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ldb3Q9JKS4 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ldb3Q9JKS4 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ldb3Q9JKS4 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ldb3Q9JKS4 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ldb3Q9JKS4 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ldb3Q9JKS4 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ldb3Q9JKS4 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ldb3Q9JKS4 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Ldb3Q9JKS4 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ldb3Q9JKS4 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ldb3Q9JKS4 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ldb3Q9JKS4 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ldb3Q9JKS4 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ldb3Q9JKS4 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ldb3Q9JKS4 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Ldb3Q9JKS4 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ldb3Q9JKS4 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ldb3Q9JKS4 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ldb3Q9JKS4 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ldb3Q9JKS4 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ldb3Q9JKS4 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Ldb3Q9JKS4 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ldb3Q9JKS4 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ldb3Q9JKS4 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ldb3Q9JKS4 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ldb3Q9JKS4 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ldb3Q9JKS4 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ldb3Q9JKS4 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ldb3Q9JKS4 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ldb3Q9JKS4 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ldb3Q9JKS4 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ldb3Q9JKS4 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ldb3Q9JKS4 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ldb3Q9JKS4 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ldb3Q9JKS4 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ldb3Q9JKS4 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ldb3Q9JKS4 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ldb3Q9JKS4 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ldb3Q9JKS4 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ldb3Q9JKS4 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ldb3Q9JKS4 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ldb3Q9JKS4 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ldb3Q9JKS4 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ldb3Q9JKS4 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ldb3Q9JKS4 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ldb3Q9JKS4 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ldb3Q9JKS4 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ldb3Q9JKS4 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ldb3Q9JKS4 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ldb3Q9JKS4 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ldb3Q9JKS4 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ldb3Q9JKS4 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Ldb3Q9JKS4 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Ldb3Q9JKS4 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ldb3Q9JKS4 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ldb3Q9JKS4 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ldb3Q9JKS4 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ldb3Q9JKS4 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ldb3Q9JKS4 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ldb3Q9JKS4 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ldb3Q9JKS4 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ldb3Q9JKS4 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ldb3Q9JKS4 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ldb3Q9JKS4 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ldb3Q9JKS4 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ldb3Q9JKS4 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ldb3Q9JKS4 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ldb3Q9JKS4 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Ldb3Q9JKS4 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Ldb3Q9JKS4 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ldb3Q9JKS4 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ldb3Q9JKS4 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ldb3Q9JKS4 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ldb3Q9JKS4 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ldb3Q9JKS4 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ldb3Q9JKS4 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ldb3Q9JKS4 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ldb3Q9JKS4 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ldb3Q9JKS4 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ldb3Q9JKS4 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ldb3Q9JKS4 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ldb3Q9JKS4 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ldb3Q9JKS4 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ldb3Q9JKS4 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ldb3Q9JKS4 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ldb3Q9JKS4 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms