Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJT2

Gfra4, GDNF family receptor alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra4Q9JJT2 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gfra4Q9JJT2 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gfra4Q9JJT2 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gfra4Q9JJT2 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gfra4Q9JJT2 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gfra4Q9JJT2 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gfra4Q9JJT2 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gfra4Q9JJT2 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gfra4Q9JJT2 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gfra4Q9JJT2 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gfra4Q9JJT2 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gfra4Q9JJT2 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gfra4Q9JJT2 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gfra4Q9JJT2 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gfra4Q9JJT2 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gfra4Q9JJT2 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gfra4Q9JJT2 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gfra4Q9JJT2 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gfra4Q9JJT2 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gfra4Q9JJT2 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gfra4Q9JJT2 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gfra4Q9JJT2 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gfra4Q9JJT2 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gfra4Q9JJT2 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gfra4Q9JJT2 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gfra4Q9JJT2 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gfra4Q9JJT2 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gfra4Q9JJT2 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gfra4Q9JJT2 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gfra4Q9JJT2 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gfra4Q9JJT2 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gfra4Q9JJT2 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gfra4Q9JJT2 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gfra4Q9JJT2 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gfra4Q9JJT2 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gfra4Q9JJT2 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Gfra4Q9JJT2 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gfra4Q9JJT2 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gfra4Q9JJT2 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gfra4Q9JJT2 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gfra4Q9JJT2 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gfra4Q9JJT2 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gfra4Q9JJT2 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gfra4Q9JJT2 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gfra4Q9JJT2 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gfra4Q9JJT2 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gfra4Q9JJT2 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gfra4Q9JJT2 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gfra4Q9JJT2 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gfra4Q9JJT2 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gfra4Q9JJT2 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gfra4Q9JJT2 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gfra4Q9JJT2 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gfra4Q9JJT2 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gfra4Q9JJT2 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gfra4Q9JJT2 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gfra4Q9JJT2 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gfra4Q9JJT2 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gfra4Q9JJT2 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gfra4Q9JJT2 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gfra4Q9JJT2 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gfra4Q9JJT2 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gfra4Q9JJT2 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gfra4Q9JJT2 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gfra4Q9JJT2 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gfra4Q9JJT2 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gfra4Q9JJT2 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gfra4Q9JJT2 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gfra4Q9JJT2 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Gfra4Q9JJT2 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gfra4Q9JJT2 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gfra4Q9JJT2 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gfra4Q9JJT2 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gfra4Q9JJT2 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gfra4Q9JJT2 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gfra4Q9JJT2 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gfra4Q9JJT2 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Gfra4Q9JJT2 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gfra4Q9JJT2 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gfra4Q9JJT2 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gfra4Q9JJT2 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Gfra4Q9JJT2 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Gfra4Q9JJT2 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Gfra4Q9JJT2 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gfra4Q9JJT2 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Gfra4Q9JJT2 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gfra4Q9JJT2 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Gfra4Q9JJT2 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gfra4Q9JJT2 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gfra4Q9JJT2 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gfra4Q9JJT2 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Gfra4Q9JJT2 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gfra4Q9JJT2 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gfra4Q9JJT2 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gfra4Q9JJT2 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gfra4Q9JJT2 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gfra4Q9JJT2 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Gfra4Q9JJT2 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gfra4Q9JJT2 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gfra4Q9JJT2 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms