Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHJ0

Tmod3, Tropomodulin-3, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod3Q9JHJ0 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmod3Q9JHJ0 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmod3Q9JHJ0 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmod3Q9JHJ0 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tmod3Q9JHJ0 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmod3Q9JHJ0 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tmod3Q9JHJ0 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tmod3Q9JHJ0 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmod3Q9JHJ0 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Tmod3Q9JHJ0 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Tmod3Q9JHJ0 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmod3Q9JHJ0 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tmod3Q9JHJ0 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tmod3Q9JHJ0 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tmod3Q9JHJ0 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmod3Q9JHJ0 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Tmod3Q9JHJ0 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tmod3Q9JHJ0 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmod3Q9JHJ0 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmod3Q9JHJ0 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmod3Q9JHJ0 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmod3Q9JHJ0 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmod3Q9JHJ0 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tmod3Q9JHJ0 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmod3Q9JHJ0 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmod3Q9JHJ0 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmod3Q9JHJ0 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmod3Q9JHJ0 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmod3Q9JHJ0 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmod3Q9JHJ0 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmod3Q9JHJ0 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmod3Q9JHJ0 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmod3Q9JHJ0 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmod3Q9JHJ0 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmod3Q9JHJ0 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tmod3Q9JHJ0 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmod3Q9JHJ0 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmod3Q9JHJ0 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmod3Q9JHJ0 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tmod3Q9JHJ0 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmod3Q9JHJ0 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmod3Q9JHJ0 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmod3Q9JHJ0 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmod3Q9JHJ0 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tmod3Q9JHJ0 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tmod3Q9JHJ0 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tmod3Q9JHJ0 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmod3Q9JHJ0 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tmod3Q9JHJ0 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmod3Q9JHJ0 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmod3Q9JHJ0 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmod3Q9JHJ0 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmod3Q9JHJ0 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Tmod3Q9JHJ0 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tmod3Q9JHJ0 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmod3Q9JHJ0 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmod3Q9JHJ0 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmod3Q9JHJ0 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmod3Q9JHJ0 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmod3Q9JHJ0 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmod3Q9JHJ0 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tmod3Q9JHJ0 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmod3Q9JHJ0 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmod3Q9JHJ0 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmod3Q9JHJ0 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tmod3Q9JHJ0 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tmod3Q9JHJ0 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tmod3Q9JHJ0 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tmod3Q9JHJ0 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tmod3Q9JHJ0 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Tmod3Q9JHJ0 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmod3Q9JHJ0 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Tmod3Q9JHJ0 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmod3Q9JHJ0 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tmod3Q9JHJ0 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tmod3Q9JHJ0 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tmod3Q9JHJ0 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmod3Q9JHJ0 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmod3Q9JHJ0 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tmod3Q9JHJ0 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmod3Q9JHJ0 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmod3Q9JHJ0 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tmod3Q9JHJ0 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmod3Q9JHJ0 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmod3Q9JHJ0 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmod3Q9JHJ0 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Tmod3Q9JHJ0 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmod3Q9JHJ0 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmod3Q9JHJ0 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmod3Q9JHJ0 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmod3Q9JHJ0 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tmod3Q9JHJ0 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmod3Q9JHJ0 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmod3Q9JHJ0 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmod3Q9JHJ0 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmod3Q9JHJ0 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmod3Q9JHJ0 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmod3Q9JHJ0 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmod3Q9JHJ0 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tmod3Q9JHJ0 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms