Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES97

Rtn3, Reticulon-3, mousemouse

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Length 964 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtn3Q9ES97 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rtn3Q9ES97 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Rtn3Q9ES97 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rtn3Q9ES97 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rtn3Q9ES97 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Rtn3Q9ES97 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rtn3Q9ES97 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rtn3Q9ES97 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rtn3Q9ES97 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rtn3Q9ES97 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rtn3Q9ES97 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rtn3Q9ES97 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rtn3Q9ES97 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rtn3Q9ES97 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rtn3Q9ES97 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rtn3Q9ES97 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rtn3Q9ES97 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rtn3Q9ES97 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rtn3Q9ES97 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rtn3Q9ES97 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rtn3Q9ES97 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rtn3Q9ES97 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rtn3Q9ES97 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rtn3Q9ES97 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rtn3Q9ES97 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rtn3Q9ES97 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rtn3Q9ES97 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rtn3Q9ES97 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rtn3Q9ES97 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rtn3Q9ES97 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rtn3Q9ES97 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rtn3Q9ES97 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rtn3Q9ES97 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rtn3Q9ES97 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rtn3Q9ES97 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rtn3Q9ES97 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rtn3Q9ES97 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rtn3Q9ES97 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rtn3Q9ES97 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rtn3Q9ES97 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rtn3Q9ES97 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rtn3Q9ES97 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rtn3Q9ES97 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rtn3Q9ES97 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rtn3Q9ES97 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rtn3Q9ES97 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rtn3Q9ES97 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rtn3Q9ES97 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rtn3Q9ES97 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rtn3Q9ES97 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Rtn3Q9ES97 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rtn3Q9ES97 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Rtn3Q9ES97 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Rtn3Q9ES97 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Rtn3Q9ES97 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rtn3Q9ES97 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rtn3Q9ES97 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rtn3Q9ES97 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rtn3Q9ES97 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rtn3Q9ES97 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rtn3Q9ES97 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rtn3Q9ES97 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rtn3Q9ES97 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rtn3Q9ES97 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rtn3Q9ES97 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rtn3Q9ES97 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rtn3Q9ES97 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Rtn3Q9ES97 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Rtn3Q9ES97 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Rtn3Q9ES97 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rtn3Q9ES97 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rtn3Q9ES97 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rtn3Q9ES97 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Rtn3Q9ES97 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rtn3Q9ES97 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Rtn3Q9ES97 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rtn3Q9ES97 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rtn3Q9ES97 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rtn3Q9ES97 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rtn3Q9ES97 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rtn3Q9ES97 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rtn3Q9ES97 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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