Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES64

Ush1c, Harmonin, mousemouse

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Length 910 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ush1cQ9ES64 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ush1cQ9ES64 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ush1cQ9ES64 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ush1cQ9ES64 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ush1cQ9ES64 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ush1cQ9ES64 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ush1cQ9ES64 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ush1cQ9ES64 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Ush1cQ9ES64 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ush1cQ9ES64 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Ush1cQ9ES64 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ush1cQ9ES64 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ush1cQ9ES64 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Ush1cQ9ES64 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ush1cQ9ES64 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ush1cQ9ES64 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ush1cQ9ES64 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ush1cQ9ES64 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Ush1cQ9ES64 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ush1cQ9ES64 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ush1cQ9ES64 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Ush1cQ9ES64 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ush1cQ9ES64 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ush1cQ9ES64 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ush1cQ9ES64 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Ush1cQ9ES64 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Ush1cQ9ES64 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Ush1cQ9ES64 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ush1cQ9ES64 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ush1cQ9ES64 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ush1cQ9ES64 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Ush1cQ9ES64 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ush1cQ9ES64 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ush1cQ9ES64 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ush1cQ9ES64 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ush1cQ9ES64 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ush1cQ9ES64 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ush1cQ9ES64 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ush1cQ9ES64 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ush1cQ9ES64 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ush1cQ9ES64 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ush1cQ9ES64 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ush1cQ9ES64 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ush1cQ9ES64 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ush1cQ9ES64 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ush1cQ9ES64 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ush1cQ9ES64 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ush1cQ9ES64 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ush1cQ9ES64 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ush1cQ9ES64 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ush1cQ9ES64 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ush1cQ9ES64 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ush1cQ9ES64 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ush1cQ9ES64 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ush1cQ9ES64 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms