Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp29Q9ES63 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp29Q9ES63 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp29Q9ES63 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp29Q9ES63 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp29Q9ES63 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp29Q9ES63 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Usp29Q9ES63 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp29Q9ES63 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp29Q9ES63 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp29Q9ES63 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Usp29Q9ES63 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp29Q9ES63 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp29Q9ES63 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Usp29Q9ES63 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp29Q9ES63 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp29Q9ES63 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp29Q9ES63 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp29Q9ES63 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp29Q9ES63 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp29Q9ES63 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp29Q9ES63 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp29Q9ES63 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp29Q9ES63 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp29Q9ES63 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp29Q9ES63 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp29Q9ES63 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp29Q9ES63 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp29Q9ES63 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp29Q9ES63 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp29Q9ES63 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp29Q9ES63 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Usp29Q9ES63 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Usp29Q9ES63 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Usp29Q9ES63 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Usp29Q9ES63 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Usp29Q9ES63 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Usp29Q9ES63 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Usp29Q9ES63 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Usp29Q9ES63 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp29Q9ES63 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp29Q9ES63 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Usp29Q9ES63 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp29Q9ES63 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp29Q9ES63 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp29Q9ES63 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp29Q9ES63 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp29Q9ES63 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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