Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES61

Ms4a4b, Chandra protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4bQ9ES61 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ms4a4bQ9ES61 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ms4a4bQ9ES61 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ms4a4bQ9ES61 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ms4a4bQ9ES61 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ms4a4bQ9ES61 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ms4a4bQ9ES61 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ms4a4bQ9ES61 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ms4a4bQ9ES61 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ms4a4bQ9ES61 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ms4a4bQ9ES61 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ms4a4bQ9ES61 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ms4a4bQ9ES61 Gm15529-201ENSMUST00000121833 994 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ms4a4bQ9ES61 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ms4a4bQ9ES61 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ms4a4bQ9ES61 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ms4a4bQ9ES61 C030010L15Rik-201ENSMUST00000181465 715 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ms4a4bQ9ES61 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ms4a4bQ9ES61 Gm29043-201ENSMUST00000186371 623 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ms4a4bQ9ES61 Gm28585-201ENSMUST00000187587 442 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ms4a4bQ9ES61 9530003O04Rik-201ENSMUST00000192663 908 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ms4a4bQ9ES61 Gm37858-201ENSMUST00000192759 1231 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ms4a4bQ9ES61 Gm37678-201ENSMUST00000192908 1146 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ms4a4bQ9ES61 Gm43491-201ENSMUST00000197133 784 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ms4a4bQ9ES61 AC164624.1-201ENSMUST00000219148 1025 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ms4a4bQ9ES61 AC132918.1-201ENSMUST00000227877 925 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ms4a4bQ9ES61 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ms4a4bQ9ES61 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ms4a4bQ9ES61 Olfr488-201ENSMUST00000072968 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ms4a4bQ9ES61 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ms4a4bQ9ES61 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ms4a4bQ9ES61 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ms4a4bQ9ES61 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ms4a4bQ9ES61 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ms4a4bQ9ES61 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ms4a4bQ9ES61 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ms4a4bQ9ES61 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ms4a4bQ9ES61 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ms4a4bQ9ES61 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ms4a4bQ9ES61 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ms4a4bQ9ES61 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ms4a4bQ9ES61 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ms4a4bQ9ES61 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ms4a4bQ9ES61 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ms4a4bQ9ES61 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ms4a4bQ9ES61 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ms4a4bQ9ES61 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ms4a4bQ9ES61 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ms4a4bQ9ES61 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ms4a4bQ9ES61 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ms4a4bQ9ES61 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ms4a4bQ9ES61 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ms4a4bQ9ES61 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ms4a4bQ9ES61 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ms4a4bQ9ES61 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ms4a4bQ9ES61 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ms4a4bQ9ES61 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ms4a4bQ9ES61 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ms4a4bQ9ES61 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ms4a4bQ9ES61 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ms4a4bQ9ES61 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ms4a4bQ9ES61 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ms4a4bQ9ES61 Gm44509-201ENSMUST00000205400 1324 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ms4a4bQ9ES61 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ms4a4bQ9ES61 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ms4a4bQ9ES61 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ms4a4bQ9ES61 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ms4a4bQ9ES61 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ms4a4bQ9ES61 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ms4a4bQ9ES61 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ms4a4bQ9ES61 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ms4a4bQ9ES61 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ms4a4bQ9ES61 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ms4a4bQ9ES61 1700057H21Rik-201ENSMUST00000152467 383 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ms4a4bQ9ES61 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ms4a4bQ9ES61 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ms4a4bQ9ES61 Gm37005-201ENSMUST00000193281 1164 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ms4a4bQ9ES61 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ms4a4bQ9ES61 Gm44200-201ENSMUST00000204883 662 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ms4a4bQ9ES61 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ms4a4bQ9ES61 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ms4a4bQ9ES61 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ms4a4bQ9ES61 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ms4a4bQ9ES61 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ms4a4bQ9ES61 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ms4a4bQ9ES61 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ms4a4bQ9ES61 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ms4a4bQ9ES61 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ms4a4bQ9ES61 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ms4a4bQ9ES61 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ms4a4bQ9ES61 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ms4a4bQ9ES61 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ms4a4bQ9ES61 Gm43149-201ENSMUST00000198162 1422 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ms4a4bQ9ES61 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ms4a4bQ9ES61 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ms4a4bQ9ES61 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ms4a4bQ9ES61 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ms4a4bQ9ES61 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ms4a4bQ9ES61 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ms4a4bQ9ES61 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms