Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCB1

Hmgn3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn3Q9DCB1 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Hmgn3Q9DCB1 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Hmgn3Q9DCB1 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hmgn3Q9DCB1 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Hmgn3Q9DCB1 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hmgn3Q9DCB1 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Hmgn3Q9DCB1 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Hmgn3Q9DCB1 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hmgn3Q9DCB1 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hmgn3Q9DCB1 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Hmgn3Q9DCB1 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Hmgn3Q9DCB1 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hmgn3Q9DCB1 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hmgn3Q9DCB1 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hmgn3Q9DCB1 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Hmgn3Q9DCB1 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hmgn3Q9DCB1 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hmgn3Q9DCB1 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hmgn3Q9DCB1 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hmgn3Q9DCB1 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hmgn3Q9DCB1 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hmgn3Q9DCB1 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hmgn3Q9DCB1 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Hmgn3Q9DCB1 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hmgn3Q9DCB1 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hmgn3Q9DCB1 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hmgn3Q9DCB1 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hmgn3Q9DCB1 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hmgn3Q9DCB1 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hmgn3Q9DCB1 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Hmgn3Q9DCB1 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hmgn3Q9DCB1 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hmgn3Q9DCB1 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hmgn3Q9DCB1 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Hmgn3Q9DCB1 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hmgn3Q9DCB1 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hmgn3Q9DCB1 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hmgn3Q9DCB1 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hmgn3Q9DCB1 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hmgn3Q9DCB1 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hmgn3Q9DCB1 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Hmgn3Q9DCB1 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Hmgn3Q9DCB1 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Hmgn3Q9DCB1 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hmgn3Q9DCB1 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hmgn3Q9DCB1 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Hmgn3Q9DCB1 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Hmgn3Q9DCB1 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Hmgn3Q9DCB1 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hmgn3Q9DCB1 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hmgn3Q9DCB1 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hmgn3Q9DCB1 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hmgn3Q9DCB1 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Hmgn3Q9DCB1 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hmgn3Q9DCB1 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Hmgn3Q9DCB1 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hmgn3Q9DCB1 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hmgn3Q9DCB1 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hmgn3Q9DCB1 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Hmgn3Q9DCB1 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Hmgn3Q9DCB1 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hmgn3Q9DCB1 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hmgn3Q9DCB1 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Hmgn3Q9DCB1 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hmgn3Q9DCB1 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hmgn3Q9DCB1 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hmgn3Q9DCB1 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hmgn3Q9DCB1 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hmgn3Q9DCB1 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Hmgn3Q9DCB1 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hmgn3Q9DCB1 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hmgn3Q9DCB1 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hmgn3Q9DCB1 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hmgn3Q9DCB1 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hmgn3Q9DCB1 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hmgn3Q9DCB1 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hmgn3Q9DCB1 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hmgn3Q9DCB1 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Hmgn3Q9DCB1 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Hmgn3Q9DCB1 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hmgn3Q9DCB1 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hmgn3Q9DCB1 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Hmgn3Q9DCB1 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hmgn3Q9DCB1 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Hmgn3Q9DCB1 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hmgn3Q9DCB1 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hmgn3Q9DCB1 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hmgn3Q9DCB1 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hmgn3Q9DCB1 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hmgn3Q9DCB1 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hmgn3Q9DCB1 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hmgn3Q9DCB1 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hmgn3Q9DCB1 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hmgn3Q9DCB1 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hmgn3Q9DCB1 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hmgn3Q9DCB1 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hmgn3Q9DCB1 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hmgn3Q9DCB1 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hmgn3Q9DCB1 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hmgn3Q9DCB1 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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