Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC28

Csnk1d, Casein kinase I isoform delta, mousemouse

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1dQ9DC28 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Csnk1dQ9DC28 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Csnk1dQ9DC28 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Csnk1dQ9DC28 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Csnk1dQ9DC28 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Csnk1dQ9DC28 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Csnk1dQ9DC28 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Csnk1dQ9DC28 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Csnk1dQ9DC28 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Csnk1dQ9DC28 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Csnk1dQ9DC28 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Csnk1dQ9DC28 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Csnk1dQ9DC28 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Csnk1dQ9DC28 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Csnk1dQ9DC28 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Csnk1dQ9DC28 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Csnk1dQ9DC28 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Csnk1dQ9DC28 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Csnk1dQ9DC28 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Csnk1dQ9DC28 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Csnk1dQ9DC28 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Csnk1dQ9DC28 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Csnk1dQ9DC28 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Csnk1dQ9DC28 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Csnk1dQ9DC28 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Csnk1dQ9DC28 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Csnk1dQ9DC28 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Csnk1dQ9DC28 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Csnk1dQ9DC28 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Csnk1dQ9DC28 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Csnk1dQ9DC28 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Csnk1dQ9DC28 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Csnk1dQ9DC28 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Csnk1dQ9DC28 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Csnk1dQ9DC28 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Csnk1dQ9DC28 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Csnk1dQ9DC28 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Csnk1dQ9DC28 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Csnk1dQ9DC28 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Csnk1dQ9DC28 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Csnk1dQ9DC28 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Csnk1dQ9DC28 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Csnk1dQ9DC28 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Csnk1dQ9DC28 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Csnk1dQ9DC28 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Csnk1dQ9DC28 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Csnk1dQ9DC28 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Csnk1dQ9DC28 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Csnk1dQ9DC28 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Csnk1dQ9DC28 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Csnk1dQ9DC28 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Csnk1dQ9DC28 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Csnk1dQ9DC28 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Csnk1dQ9DC28 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Csnk1dQ9DC28 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Csnk1dQ9DC28 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Csnk1dQ9DC28 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Csnk1dQ9DC28 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Csnk1dQ9DC28 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Csnk1dQ9DC28 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Csnk1dQ9DC28 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Csnk1dQ9DC28 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Csnk1dQ9DC28 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Csnk1dQ9DC28 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Csnk1dQ9DC28 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Csnk1dQ9DC28 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Csnk1dQ9DC28 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Csnk1dQ9DC28 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Csnk1dQ9DC28 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Csnk1dQ9DC28 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Csnk1dQ9DC28 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Csnk1dQ9DC28 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Csnk1dQ9DC28 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Csnk1dQ9DC28 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Csnk1dQ9DC28 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Csnk1dQ9DC28 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Csnk1dQ9DC28 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Csnk1dQ9DC28 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Csnk1dQ9DC28 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Csnk1dQ9DC28 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Csnk1dQ9DC28 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Csnk1dQ9DC28 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Csnk1dQ9DC28 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Csnk1dQ9DC28 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Csnk1dQ9DC28 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Csnk1dQ9DC28 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Csnk1dQ9DC28 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Csnk1dQ9DC28 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Csnk1dQ9DC28 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Csnk1dQ9DC28 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Csnk1dQ9DC28 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Csnk1dQ9DC28 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Csnk1dQ9DC28 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Csnk1dQ9DC28 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Csnk1dQ9DC28 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Csnk1dQ9DC28 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Csnk1dQ9DC28 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Csnk1dQ9DC28 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Csnk1dQ9DC28 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Csnk1dQ9DC28 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.9 ms