Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB34

Chmp2a, Charged multivesicular body protein 2a, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp2aQ9DB34 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chmp2aQ9DB34 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chmp2aQ9DB34 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chmp2aQ9DB34 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chmp2aQ9DB34 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chmp2aQ9DB34 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chmp2aQ9DB34 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chmp2aQ9DB34 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chmp2aQ9DB34 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chmp2aQ9DB34 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chmp2aQ9DB34 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chmp2aQ9DB34 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chmp2aQ9DB34 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Chmp2aQ9DB34 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chmp2aQ9DB34 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chmp2aQ9DB34 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chmp2aQ9DB34 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Chmp2aQ9DB34 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chmp2aQ9DB34 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chmp2aQ9DB34 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chmp2aQ9DB34 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chmp2aQ9DB34 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chmp2aQ9DB34 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chmp2aQ9DB34 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chmp2aQ9DB34 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chmp2aQ9DB34 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chmp2aQ9DB34 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chmp2aQ9DB34 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chmp2aQ9DB34 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chmp2aQ9DB34 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Chmp2aQ9DB34 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Chmp2aQ9DB34 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Chmp2aQ9DB34 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Chmp2aQ9DB34 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Chmp2aQ9DB34 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Chmp2aQ9DB34 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Chmp2aQ9DB34 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Chmp2aQ9DB34 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Chmp2aQ9DB34 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Chmp2aQ9DB34 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Chmp2aQ9DB34 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Chmp2aQ9DB34 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Chmp2aQ9DB34 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Chmp2aQ9DB34 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Chmp2aQ9DB34 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Chmp2aQ9DB34 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Chmp2aQ9DB34 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Chmp2aQ9DB34 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Chmp2aQ9DB34 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Chmp2aQ9DB34 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Chmp2aQ9DB34 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Chmp2aQ9DB34 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Chmp2aQ9DB34 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Chmp2aQ9DB34 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Chmp2aQ9DB34 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Chmp2aQ9DB34 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Chmp2aQ9DB34 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Chmp2aQ9DB34 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Chmp2aQ9DB34 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Chmp2aQ9DB34 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Chmp2aQ9DB34 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Chmp2aQ9DB34 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Chmp2aQ9DB34 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Chmp2aQ9DB34 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Chmp2aQ9DB34 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Chmp2aQ9DB34 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Chmp2aQ9DB34 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Chmp2aQ9DB34 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Chmp2aQ9DB34 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Chmp2aQ9DB34 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Chmp2aQ9DB34 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Chmp2aQ9DB34 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Chmp2aQ9DB34 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Chmp2aQ9DB34 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Chmp2aQ9DB34 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Chmp2aQ9DB34 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Chmp2aQ9DB34 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Chmp2aQ9DB34 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Chmp2aQ9DB34 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Chmp2aQ9DB34 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Chmp2aQ9DB34 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Chmp2aQ9DB34 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Chmp2aQ9DB34 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Chmp2aQ9DB34 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Chmp2aQ9DB34 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Chmp2aQ9DB34 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Chmp2aQ9DB34 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Chmp2aQ9DB34 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Chmp2aQ9DB34 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Chmp2aQ9DB34 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Chmp2aQ9DB34 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Chmp2aQ9DB34 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Chmp2aQ9DB34 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Chmp2aQ9DB34 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Chmp2aQ9DB34 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Chmp2aQ9DB34 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Chmp2aQ9DB34 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Chmp2aQ9DB34 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Chmp2aQ9DB34 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Chmp2aQ9DB34 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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