Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8L0

Uncharacterized protein C11orf52 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D8L0 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q9D8L0 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q9D8L0 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q9D8L0 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q9D8L0 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q9D8L0 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q9D8L0 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q9D8L0 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q9D8L0 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q9D8L0 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q9D8L0 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q9D8L0 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q9D8L0 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q9D8L0 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q9D8L0 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q9D8L0 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q9D8L0 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q9D8L0 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q9D8L0 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q9D8L0 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q9D8L0 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q9D8L0 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q9D8L0 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q9D8L0 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q9D8L0 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q9D8L0 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q9D8L0 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q9D8L0 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q9D8L0 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q9D8L0 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q9D8L0 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q9D8L0 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q9D8L0 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q9D8L0 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Q9D8L0 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q9D8L0 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q9D8L0 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q9D8L0 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q9D8L0 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q9D8L0 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q9D8L0 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q9D8L0 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q9D8L0 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q9D8L0 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q9D8L0 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q9D8L0 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q9D8L0 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q9D8L0 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q9D8L0 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q9D8L0 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q9D8L0 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q9D8L0 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q9D8L0 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q9D8L0 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q9D8L0 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q9D8L0 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q9D8L0 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q9D8L0 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q9D8L0 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q9D8L0 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q9D8L0 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q9D8L0 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q9D8L0 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q9D8L0 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q9D8L0 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q9D8L0 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q9D8L0 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q9D8L0 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Q9D8L0 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q9D8L0 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q9D8L0 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q9D8L0 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q9D8L0 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Q9D8L0 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q9D8L0 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q9D8L0 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q9D8L0 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q9D8L0 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Q9D8L0 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Q9D8L0 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Q9D8L0 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Q9D8L0 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Q9D8L0 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q9D8L0 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Q9D8L0 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Q9D8L0 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Q9D8L0 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Q9D8L0 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Q9D8L0 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Q9D8L0 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Q9D8L0 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Q9D8L0 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q9D8L0 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q9D8L0 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q9D8L0 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q9D8L0 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q9D8L0 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Q9D8L0 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Q9D8L0 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q9D8L0 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms