Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J3

Ccdc94, Coiled-coil domain-containing protein 94, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc94Q9D6J3 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc94Q9D6J3 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc94Q9D6J3 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc94Q9D6J3 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc94Q9D6J3 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc94Q9D6J3 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc94Q9D6J3 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc94Q9D6J3 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc94Q9D6J3 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc94Q9D6J3 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc94Q9D6J3 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc94Q9D6J3 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc94Q9D6J3 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc94Q9D6J3 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc94Q9D6J3 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc94Q9D6J3 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc94Q9D6J3 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc94Q9D6J3 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc94Q9D6J3 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc94Q9D6J3 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc94Q9D6J3 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc94Q9D6J3 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc94Q9D6J3 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc94Q9D6J3 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc94Q9D6J3 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc94Q9D6J3 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc94Q9D6J3 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc94Q9D6J3 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc94Q9D6J3 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc94Q9D6J3 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc94Q9D6J3 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc94Q9D6J3 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc94Q9D6J3 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc94Q9D6J3 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc94Q9D6J3 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc94Q9D6J3 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc94Q9D6J3 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc94Q9D6J3 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc94Q9D6J3 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc94Q9D6J3 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc94Q9D6J3 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc94Q9D6J3 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc94Q9D6J3 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc94Q9D6J3 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc94Q9D6J3 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc94Q9D6J3 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc94Q9D6J3 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc94Q9D6J3 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc94Q9D6J3 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc94Q9D6J3 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc94Q9D6J3 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc94Q9D6J3 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc94Q9D6J3 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc94Q9D6J3 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc94Q9D6J3 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc94Q9D6J3 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc94Q9D6J3 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc94Q9D6J3 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc94Q9D6J3 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc94Q9D6J3 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc94Q9D6J3 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc94Q9D6J3 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc94Q9D6J3 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc94Q9D6J3 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc94Q9D6J3 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc94Q9D6J3 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc94Q9D6J3 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc94Q9D6J3 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc94Q9D6J3 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc94Q9D6J3 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc94Q9D6J3 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc94Q9D6J3 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc94Q9D6J3 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc94Q9D6J3 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc94Q9D6J3 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc94Q9D6J3 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc94Q9D6J3 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc94Q9D6J3 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc94Q9D6J3 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc94Q9D6J3 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc94Q9D6J3 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc94Q9D6J3 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc94Q9D6J3 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc94Q9D6J3 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc94Q9D6J3 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc94Q9D6J3 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc94Q9D6J3 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc94Q9D6J3 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc94Q9D6J3 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc94Q9D6J3 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc94Q9D6J3 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc94Q9D6J3 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc94Q9D6J3 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc94Q9D6J3 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc94Q9D6J3 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc94Q9D6J3 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc94Q9D6J3 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc94Q9D6J3 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc94Q9D6J3 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc94Q9D6J3 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms