Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6E4

Ttc9b, Tetratricopeptide repeat protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9bQ9D6E4 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ttc9bQ9D6E4 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ttc9bQ9D6E4 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ttc9bQ9D6E4 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ttc9bQ9D6E4 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC14.46□□□□□ -0.1
Ttc9bQ9D6E4 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ttc9bQ9D6E4 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC14.46□□□□□ -0.1
Ttc9bQ9D6E4 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ttc9bQ9D6E4 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ttc9bQ9D6E4 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms