Protein–RNA interactions for Protein: Q9D541

Ccdc7, Coiled-coil domain-containing protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7Q9D541 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc7Q9D541 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc7Q9D541 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc7Q9D541 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc7Q9D541 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc7Q9D541 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc7Q9D541 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc7Q9D541 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc7Q9D541 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc7Q9D541 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc7Q9D541 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc7Q9D541 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc7Q9D541 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc7Q9D541 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc7Q9D541 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc7Q9D541 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc7Q9D541 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc7Q9D541 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc7Q9D541 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc7Q9D541 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc7Q9D541 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc7Q9D541 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc7Q9D541 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc7Q9D541 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc7Q9D541 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc7Q9D541 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc7Q9D541 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc7Q9D541 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc7Q9D541 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc7Q9D541 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc7Q9D541 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc7Q9D541 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc7Q9D541 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc7Q9D541 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc7Q9D541 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc7Q9D541 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc7Q9D541 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc7Q9D541 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc7Q9D541 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc7Q9D541 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc7Q9D541 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc7Q9D541 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc7Q9D541 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc7Q9D541 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc7Q9D541 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc7Q9D541 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc7Q9D541 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc7Q9D541 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc7Q9D541 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc7Q9D541 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc7Q9D541 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc7Q9D541 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc7Q9D541 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc7Q9D541 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc7Q9D541 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc7Q9D541 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc7Q9D541 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc7Q9D541 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc7Q9D541 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc7Q9D541 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc7Q9D541 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc7Q9D541 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc7Q9D541 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc7Q9D541 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc7Q9D541 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc7Q9D541 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc7Q9D541 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc7Q9D541 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc7Q9D541 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc7Q9D541 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc7Q9D541 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc7Q9D541 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc7Q9D541 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc7Q9D541 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc7Q9D541 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc7Q9D541 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc7Q9D541 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc7Q9D541 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc7Q9D541 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc7Q9D541 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc7Q9D541 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc7Q9D541 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc7Q9D541 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc7Q9D541 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc7Q9D541 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc7Q9D541 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc7Q9D541 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc7Q9D541 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc7Q9D541 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc7Q9D541 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc7Q9D541 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc7Q9D541 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc7Q9D541 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc7Q9D541 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc7Q9D541 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc7Q9D541 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc7Q9D541 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc7Q9D541 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc7Q9D541 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc7Q9D541 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms