Protein–RNA interactions for Protein: Q9D506

Gm3404, Predicted gene 3404, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3404Q9D506 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3404Q9D506 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3404Q9D506 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3404Q9D506 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3404Q9D506 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3404Q9D506 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3404Q9D506 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3404Q9D506 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3404Q9D506 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3404Q9D506 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3404Q9D506 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3404Q9D506 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3404Q9D506 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3404Q9D506 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3404Q9D506 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3404Q9D506 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3404Q9D506 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3404Q9D506 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3404Q9D506 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3404Q9D506 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3404Q9D506 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3404Q9D506 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3404Q9D506 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3404Q9D506 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3404Q9D506 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3404Q9D506 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3404Q9D506 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3404Q9D506 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3404Q9D506 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3404Q9D506 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3404Q9D506 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3404Q9D506 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3404Q9D506 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3404Q9D506 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3404Q9D506 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3404Q9D506 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3404Q9D506 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3404Q9D506 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3404Q9D506 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3404Q9D506 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3404Q9D506 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3404Q9D506 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3404Q9D506 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3404Q9D506 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3404Q9D506 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3404Q9D506 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3404Q9D506 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3404Q9D506 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3404Q9D506 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3404Q9D506 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3404Q9D506 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3404Q9D506 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3404Q9D506 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3404Q9D506 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3404Q9D506 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3404Q9D506 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3404Q9D506 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3404Q9D506 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3404Q9D506 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3404Q9D506 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3404Q9D506 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3404Q9D506 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3404Q9D506 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3404Q9D506 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3404Q9D506 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3404Q9D506 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3404Q9D506 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3404Q9D506 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3404Q9D506 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3404Q9D506 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3404Q9D506 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3404Q9D506 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3404Q9D506 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3404Q9D506 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3404Q9D506 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3404Q9D506 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3404Q9D506 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3404Q9D506 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3404Q9D506 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3404Q9D506 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3404Q9D506 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3404Q9D506 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3404Q9D506 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3404Q9D506 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3404Q9D506 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3404Q9D506 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3404Q9D506 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3404Q9D506 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3404Q9D506 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3404Q9D506 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3404Q9D506 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm3404Q9D506 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm3404Q9D506 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm3404Q9D506 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm3404Q9D506 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm3404Q9D506 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm3404Q9D506 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm3404Q9D506 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm3404Q9D506 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm3404Q9D506 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms