Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4E6

Pabpc6, Polyadenylate-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 643 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc6Q9D4E6 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pabpc6Q9D4E6 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pabpc6Q9D4E6 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pabpc6Q9D4E6 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pabpc6Q9D4E6 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pabpc6Q9D4E6 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pabpc6Q9D4E6 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pabpc6Q9D4E6 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pabpc6Q9D4E6 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pabpc6Q9D4E6 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pabpc6Q9D4E6 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pabpc6Q9D4E6 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pabpc6Q9D4E6 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pabpc6Q9D4E6 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pabpc6Q9D4E6 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pabpc6Q9D4E6 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pabpc6Q9D4E6 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pabpc6Q9D4E6 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pabpc6Q9D4E6 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pabpc6Q9D4E6 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pabpc6Q9D4E6 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pabpc6Q9D4E6 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pabpc6Q9D4E6 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pabpc6Q9D4E6 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pabpc6Q9D4E6 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pabpc6Q9D4E6 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pabpc6Q9D4E6 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pabpc6Q9D4E6 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pabpc6Q9D4E6 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pabpc6Q9D4E6 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pabpc6Q9D4E6 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pabpc6Q9D4E6 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pabpc6Q9D4E6 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pabpc6Q9D4E6 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pabpc6Q9D4E6 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pabpc6Q9D4E6 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pabpc6Q9D4E6 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pabpc6Q9D4E6 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pabpc6Q9D4E6 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pabpc6Q9D4E6 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pabpc6Q9D4E6 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pabpc6Q9D4E6 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pabpc6Q9D4E6 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pabpc6Q9D4E6 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pabpc6Q9D4E6 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Pabpc6Q9D4E6 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pabpc6Q9D4E6 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pabpc6Q9D4E6 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pabpc6Q9D4E6 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pabpc6Q9D4E6 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pabpc6Q9D4E6 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pabpc6Q9D4E6 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pabpc6Q9D4E6 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Pabpc6Q9D4E6 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pabpc6Q9D4E6 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pabpc6Q9D4E6 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pabpc6Q9D4E6 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pabpc6Q9D4E6 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Pabpc6Q9D4E6 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Pabpc6Q9D4E6 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Pabpc6Q9D4E6 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pabpc6Q9D4E6 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pabpc6Q9D4E6 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pabpc6Q9D4E6 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pabpc6Q9D4E6 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pabpc6Q9D4E6 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pabpc6Q9D4E6 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pabpc6Q9D4E6 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pabpc6Q9D4E6 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pabpc6Q9D4E6 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pabpc6Q9D4E6 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pabpc6Q9D4E6 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pabpc6Q9D4E6 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pabpc6Q9D4E6 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pabpc6Q9D4E6 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pabpc6Q9D4E6 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pabpc6Q9D4E6 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pabpc6Q9D4E6 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pabpc6Q9D4E6 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pabpc6Q9D4E6 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pabpc6Q9D4E6 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pabpc6Q9D4E6 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pabpc6Q9D4E6 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pabpc6Q9D4E6 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pabpc6Q9D4E6 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pabpc6Q9D4E6 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pabpc6Q9D4E6 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pabpc6Q9D4E6 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pabpc6Q9D4E6 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pabpc6Q9D4E6 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pabpc6Q9D4E6 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pabpc6Q9D4E6 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pabpc6Q9D4E6 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pabpc6Q9D4E6 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pabpc6Q9D4E6 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pabpc6Q9D4E6 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pabpc6Q9D4E6 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pabpc6Q9D4E6 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pabpc6Q9D4E6 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pabpc6Q9D4E6 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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