Protein–RNA interactions for Protein: Q9D479

Uvssa, UV-stimulated scaffold protein A, mousemouse

Predictions only

Length 717 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UvssaQ9D479 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
UvssaQ9D479 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
UvssaQ9D479 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
UvssaQ9D479 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
UvssaQ9D479 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
UvssaQ9D479 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
UvssaQ9D479 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
UvssaQ9D479 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
UvssaQ9D479 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
UvssaQ9D479 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
UvssaQ9D479 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
UvssaQ9D479 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
UvssaQ9D479 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
UvssaQ9D479 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
UvssaQ9D479 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
UvssaQ9D479 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
UvssaQ9D479 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
UvssaQ9D479 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
UvssaQ9D479 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
UvssaQ9D479 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
UvssaQ9D479 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
UvssaQ9D479 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
UvssaQ9D479 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
UvssaQ9D479 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
UvssaQ9D479 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UvssaQ9D479 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
UvssaQ9D479 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
UvssaQ9D479 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
UvssaQ9D479 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UvssaQ9D479 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UvssaQ9D479 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UvssaQ9D479 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
UvssaQ9D479 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
UvssaQ9D479 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
UvssaQ9D479 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
UvssaQ9D479 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
UvssaQ9D479 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
UvssaQ9D479 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UvssaQ9D479 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
UvssaQ9D479 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
UvssaQ9D479 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
UvssaQ9D479 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
UvssaQ9D479 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UvssaQ9D479 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UvssaQ9D479 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
UvssaQ9D479 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
UvssaQ9D479 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
UvssaQ9D479 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UvssaQ9D479 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
UvssaQ9D479 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UvssaQ9D479 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UvssaQ9D479 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
UvssaQ9D479 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
UvssaQ9D479 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
UvssaQ9D479 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
UvssaQ9D479 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UvssaQ9D479 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UvssaQ9D479 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UvssaQ9D479 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
UvssaQ9D479 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
UvssaQ9D479 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UvssaQ9D479 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
UvssaQ9D479 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UvssaQ9D479 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UvssaQ9D479 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UvssaQ9D479 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
UvssaQ9D479 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
UvssaQ9D479 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
UvssaQ9D479 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
UvssaQ9D479 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
UvssaQ9D479 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UvssaQ9D479 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UvssaQ9D479 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UvssaQ9D479 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
UvssaQ9D479 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UvssaQ9D479 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UvssaQ9D479 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UvssaQ9D479 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UvssaQ9D479 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UvssaQ9D479 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UvssaQ9D479 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UvssaQ9D479 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UvssaQ9D479 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UvssaQ9D479 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UvssaQ9D479 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UvssaQ9D479 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UvssaQ9D479 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UvssaQ9D479 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UvssaQ9D479 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UvssaQ9D479 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UvssaQ9D479 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UvssaQ9D479 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UvssaQ9D479 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UvssaQ9D479 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UvssaQ9D479 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UvssaQ9D479 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UvssaQ9D479 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
UvssaQ9D479 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UvssaQ9D479 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
UvssaQ9D479 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms