Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Syf2Q9D198 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Syf2Q9D198 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Syf2Q9D198 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Syf2Q9D198 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Syf2Q9D198 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Syf2Q9D198 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Syf2Q9D198 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Syf2Q9D198 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Syf2Q9D198 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Syf2Q9D198 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Syf2Q9D198 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Syf2Q9D198 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Syf2Q9D198 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Syf2Q9D198 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Syf2Q9D198 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Syf2Q9D198 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Syf2Q9D198 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Syf2Q9D198 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Syf2Q9D198 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Syf2Q9D198 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Syf2Q9D198 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Syf2Q9D198 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Syf2Q9D198 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Syf2Q9D198 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Syf2Q9D198 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Syf2Q9D198 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Syf2Q9D198 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Syf2Q9D198 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Syf2Q9D198 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Syf2Q9D198 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Syf2Q9D198 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Syf2Q9D198 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Syf2Q9D198 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Syf2Q9D198 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Syf2Q9D198 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Syf2Q9D198 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Syf2Q9D198 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Syf2Q9D198 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Syf2Q9D198 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Syf2Q9D198 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Syf2Q9D198 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Syf2Q9D198 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Syf2Q9D198 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Syf2Q9D198 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Syf2Q9D198 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Syf2Q9D198 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Syf2Q9D198 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Syf2Q9D198 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Syf2Q9D198 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Syf2Q9D198 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Syf2Q9D198 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Syf2Q9D198 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Syf2Q9D198 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Syf2Q9D198 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Syf2Q9D198 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Syf2Q9D198 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Syf2Q9D198 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Syf2Q9D198 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Syf2Q9D198 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Syf2Q9D198 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Syf2Q9D198 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Syf2Q9D198 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Syf2Q9D198 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Syf2Q9D198 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Syf2Q9D198 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Syf2Q9D198 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Syf2Q9D198 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Syf2Q9D198 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Syf2Q9D198 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Syf2Q9D198 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Syf2Q9D198 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Syf2Q9D198 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Syf2Q9D198 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Syf2Q9D198 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Syf2Q9D198 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Syf2Q9D198 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Syf2Q9D198 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Syf2Q9D198 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Syf2Q9D198 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Syf2Q9D198 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Syf2Q9D198 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Syf2Q9D198 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Syf2Q9D198 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Syf2Q9D198 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Syf2Q9D198 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Syf2Q9D198 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Syf2Q9D198 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Syf2Q9D198 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Syf2Q9D198 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Syf2Q9D198 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Syf2Q9D198 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Syf2Q9D198 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Syf2Q9D198 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Syf2Q9D198 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Syf2Q9D198 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Syf2Q9D198 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Syf2Q9D198 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Syf2Q9D198 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Syf2Q9D198 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms