Protein–RNA interactions for Protein: Q9D162

Ccdc167, Coiled-coil domain-containing protein 167, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc167Q9D162 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc167Q9D162 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc167Q9D162 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc167Q9D162 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc167Q9D162 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc167Q9D162 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc167Q9D162 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc167Q9D162 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc167Q9D162 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc167Q9D162 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc167Q9D162 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc167Q9D162 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc167Q9D162 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc167Q9D162 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc167Q9D162 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc167Q9D162 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc167Q9D162 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc167Q9D162 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc167Q9D162 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc167Q9D162 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc167Q9D162 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc167Q9D162 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc167Q9D162 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc167Q9D162 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc167Q9D162 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc167Q9D162 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc167Q9D162 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc167Q9D162 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc167Q9D162 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc167Q9D162 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc167Q9D162 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc167Q9D162 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc167Q9D162 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc167Q9D162 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc167Q9D162 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc167Q9D162 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc167Q9D162 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc167Q9D162 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc167Q9D162 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc167Q9D162 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc167Q9D162 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc167Q9D162 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc167Q9D162 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc167Q9D162 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc167Q9D162 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc167Q9D162 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc167Q9D162 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc167Q9D162 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc167Q9D162 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc167Q9D162 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc167Q9D162 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc167Q9D162 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc167Q9D162 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc167Q9D162 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc167Q9D162 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc167Q9D162 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc167Q9D162 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc167Q9D162 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc167Q9D162 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc167Q9D162 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc167Q9D162 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc167Q9D162 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc167Q9D162 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc167Q9D162 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc167Q9D162 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc167Q9D162 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc167Q9D162 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc167Q9D162 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc167Q9D162 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc167Q9D162 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc167Q9D162 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc167Q9D162 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc167Q9D162 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc167Q9D162 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc167Q9D162 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc167Q9D162 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc167Q9D162 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc167Q9D162 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc167Q9D162 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc167Q9D162 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc167Q9D162 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc167Q9D162 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc167Q9D162 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc167Q9D162 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc167Q9D162 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc167Q9D162 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc167Q9D162 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc167Q9D162 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc167Q9D162 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc167Q9D162 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc167Q9D162 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc167Q9D162 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc167Q9D162 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc167Q9D162 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc167Q9D162 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc167Q9D162 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc167Q9D162 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc167Q9D162 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc167Q9D162 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc167Q9D162 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms