Protein–RNA interactions for Protein: Q9D071

Mms19, MMS19 nucleotide excision repair protein homolog, mousemouse

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Length 1,031 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mms19Q9D071 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mms19Q9D071 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Mms19Q9D071 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mms19Q9D071 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mms19Q9D071 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Mms19Q9D071 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mms19Q9D071 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mms19Q9D071 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mms19Q9D071 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mms19Q9D071 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mms19Q9D071 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mms19Q9D071 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mms19Q9D071 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mms19Q9D071 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mms19Q9D071 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mms19Q9D071 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mms19Q9D071 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mms19Q9D071 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mms19Q9D071 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mms19Q9D071 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Mms19Q9D071 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mms19Q9D071 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Mms19Q9D071 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mms19Q9D071 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mms19Q9D071 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mms19Q9D071 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mms19Q9D071 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mms19Q9D071 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mms19Q9D071 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mms19Q9D071 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mms19Q9D071 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mms19Q9D071 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Mms19Q9D071 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mms19Q9D071 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mms19Q9D071 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mms19Q9D071 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mms19Q9D071 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Mms19Q9D071 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mms19Q9D071 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mms19Q9D071 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Mms19Q9D071 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Mms19Q9D071 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Mms19Q9D071 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Mms19Q9D071 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Mms19Q9D071 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Mms19Q9D071 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Mms19Q9D071 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mms19Q9D071 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mms19Q9D071 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mms19Q9D071 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
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Mms19Q9D071 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Mms19Q9D071 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Mms19Q9D071 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Mms19Q9D071 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mms19Q9D071 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mms19Q9D071 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mms19Q9D071 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mms19Q9D071 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mms19Q9D071 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mms19Q9D071 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mms19Q9D071 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mms19Q9D071 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mms19Q9D071 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mms19Q9D071 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mms19Q9D071 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mms19Q9D071 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mms19Q9D071 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mms19Q9D071 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mms19Q9D071 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mms19Q9D071 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mms19Q9D071 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Mms19Q9D071 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mms19Q9D071 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mms19Q9D071 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mms19Q9D071 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mms19Q9D071 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mms19Q9D071 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mms19Q9D071 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mms19Q9D071 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Mms19Q9D071 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Mms19Q9D071 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mms19Q9D071 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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