Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZX0

Elp3, Elongator complex protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Elp3Q9CZX0 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Elp3Q9CZX0 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Elp3Q9CZX0 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Elp3Q9CZX0 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Elp3Q9CZX0 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Elp3Q9CZX0 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Elp3Q9CZX0 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Elp3Q9CZX0 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Elp3Q9CZX0 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Elp3Q9CZX0 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Elp3Q9CZX0 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Elp3Q9CZX0 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Elp3Q9CZX0 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Elp3Q9CZX0 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Elp3Q9CZX0 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Elp3Q9CZX0 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Elp3Q9CZX0 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Elp3Q9CZX0 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Elp3Q9CZX0 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Elp3Q9CZX0 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Elp3Q9CZX0 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Elp3Q9CZX0 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Elp3Q9CZX0 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Elp3Q9CZX0 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Elp3Q9CZX0 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Elp3Q9CZX0 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Elp3Q9CZX0 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Elp3Q9CZX0 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Elp3Q9CZX0 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Elp3Q9CZX0 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Elp3Q9CZX0 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Elp3Q9CZX0 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Elp3Q9CZX0 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Elp3Q9CZX0 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Elp3Q9CZX0 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Elp3Q9CZX0 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Elp3Q9CZX0 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Elp3Q9CZX0 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Elp3Q9CZX0 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Elp3Q9CZX0 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Elp3Q9CZX0 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Elp3Q9CZX0 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Elp3Q9CZX0 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Elp3Q9CZX0 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Elp3Q9CZX0 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Elp3Q9CZX0 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Elp3Q9CZX0 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Elp3Q9CZX0 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Elp3Q9CZX0 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Elp3Q9CZX0 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Elp3Q9CZX0 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Elp3Q9CZX0 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Elp3Q9CZX0 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Elp3Q9CZX0 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Elp3Q9CZX0 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Elp3Q9CZX0 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Elp3Q9CZX0 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Elp3Q9CZX0 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Elp3Q9CZX0 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Elp3Q9CZX0 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Elp3Q9CZX0 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Elp3Q9CZX0 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Elp3Q9CZX0 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Elp3Q9CZX0 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Elp3Q9CZX0 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Elp3Q9CZX0 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Elp3Q9CZX0 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Elp3Q9CZX0 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Elp3Q9CZX0 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Elp3Q9CZX0 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Elp3Q9CZX0 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Elp3Q9CZX0 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Elp3Q9CZX0 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Elp3Q9CZX0 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Elp3Q9CZX0 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Elp3Q9CZX0 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Elp3Q9CZX0 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Elp3Q9CZX0 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Elp3Q9CZX0 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Elp3Q9CZX0 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Elp3Q9CZX0 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Elp3Q9CZX0 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Elp3Q9CZX0 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Elp3Q9CZX0 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Elp3Q9CZX0 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Elp3Q9CZX0 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Elp3Q9CZX0 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Elp3Q9CZX0 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Elp3Q9CZX0 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Elp3Q9CZX0 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Elp3Q9CZX0 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Elp3Q9CZX0 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Elp3Q9CZX0 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Elp3Q9CZX0 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Elp3Q9CZX0 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Elp3Q9CZX0 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Elp3Q9CZX0 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Elp3Q9CZX0 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Elp3Q9CZX0 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Elp3Q9CZX0 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms