Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYW4

Hdhd3, Haloacid dehalogenase-like hydrolase domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdhd3Q9CYW4 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hdhd3Q9CYW4 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hdhd3Q9CYW4 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hdhd3Q9CYW4 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hdhd3Q9CYW4 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hdhd3Q9CYW4 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hdhd3Q9CYW4 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hdhd3Q9CYW4 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hdhd3Q9CYW4 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hdhd3Q9CYW4 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hdhd3Q9CYW4 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hdhd3Q9CYW4 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hdhd3Q9CYW4 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hdhd3Q9CYW4 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hdhd3Q9CYW4 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Hdhd3Q9CYW4 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Hdhd3Q9CYW4 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Hdhd3Q9CYW4 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Hdhd3Q9CYW4 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Hdhd3Q9CYW4 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Hdhd3Q9CYW4 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Hdhd3Q9CYW4 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Hdhd3Q9CYW4 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Hdhd3Q9CYW4 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Hdhd3Q9CYW4 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Hdhd3Q9CYW4 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hdhd3Q9CYW4 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hdhd3Q9CYW4 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hdhd3Q9CYW4 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hdhd3Q9CYW4 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hdhd3Q9CYW4 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hdhd3Q9CYW4 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hdhd3Q9CYW4 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Hdhd3Q9CYW4 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hdhd3Q9CYW4 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hdhd3Q9CYW4 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hdhd3Q9CYW4 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hdhd3Q9CYW4 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hdhd3Q9CYW4 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hdhd3Q9CYW4 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hdhd3Q9CYW4 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hdhd3Q9CYW4 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hdhd3Q9CYW4 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hdhd3Q9CYW4 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hdhd3Q9CYW4 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hdhd3Q9CYW4 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hdhd3Q9CYW4 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hdhd3Q9CYW4 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hdhd3Q9CYW4 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hdhd3Q9CYW4 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hdhd3Q9CYW4 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hdhd3Q9CYW4 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hdhd3Q9CYW4 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hdhd3Q9CYW4 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hdhd3Q9CYW4 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hdhd3Q9CYW4 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hdhd3Q9CYW4 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hdhd3Q9CYW4 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hdhd3Q9CYW4 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hdhd3Q9CYW4 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Hdhd3Q9CYW4 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Hdhd3Q9CYW4 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hdhd3Q9CYW4 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hdhd3Q9CYW4 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hdhd3Q9CYW4 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hdhd3Q9CYW4 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Hdhd3Q9CYW4 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hdhd3Q9CYW4 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hdhd3Q9CYW4 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hdhd3Q9CYW4 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Hdhd3Q9CYW4 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hdhd3Q9CYW4 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hdhd3Q9CYW4 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hdhd3Q9CYW4 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hdhd3Q9CYW4 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hdhd3Q9CYW4 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hdhd3Q9CYW4 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hdhd3Q9CYW4 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hdhd3Q9CYW4 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Hdhd3Q9CYW4 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hdhd3Q9CYW4 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hdhd3Q9CYW4 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hdhd3Q9CYW4 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hdhd3Q9CYW4 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Hdhd3Q9CYW4 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hdhd3Q9CYW4 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hdhd3Q9CYW4 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hdhd3Q9CYW4 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hdhd3Q9CYW4 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hdhd3Q9CYW4 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hdhd3Q9CYW4 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hdhd3Q9CYW4 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hdhd3Q9CYW4 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hdhd3Q9CYW4 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hdhd3Q9CYW4 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hdhd3Q9CYW4 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hdhd3Q9CYW4 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Hdhd3Q9CYW4 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hdhd3Q9CYW4 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hdhd3Q9CYW4 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms