Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT3

Snx10, Sorting nexin-10, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx10Q9CWT3 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snx10Q9CWT3 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snx10Q9CWT3 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snx10Q9CWT3 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snx10Q9CWT3 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Snx10Q9CWT3 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snx10Q9CWT3 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snx10Q9CWT3 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Snx10Q9CWT3 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snx10Q9CWT3 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Snx10Q9CWT3 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Snx10Q9CWT3 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snx10Q9CWT3 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx10Q9CWT3 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx10Q9CWT3 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx10Q9CWT3 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx10Q9CWT3 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Snx10Q9CWT3 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx10Q9CWT3 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx10Q9CWT3 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Snx10Q9CWT3 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Snx10Q9CWT3 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx10Q9CWT3 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx10Q9CWT3 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Snx10Q9CWT3 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx10Q9CWT3 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Snx10Q9CWT3 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx10Q9CWT3 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx10Q9CWT3 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Snx10Q9CWT3 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Snx10Q9CWT3 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Snx10Q9CWT3 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx10Q9CWT3 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx10Q9CWT3 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Snx10Q9CWT3 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx10Q9CWT3 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Snx10Q9CWT3 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Snx10Q9CWT3 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx10Q9CWT3 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Snx10Q9CWT3 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx10Q9CWT3 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx10Q9CWT3 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx10Q9CWT3 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx10Q9CWT3 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Snx10Q9CWT3 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx10Q9CWT3 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx10Q9CWT3 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx10Q9CWT3 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx10Q9CWT3 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx10Q9CWT3 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx10Q9CWT3 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx10Q9CWT3 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx10Q9CWT3 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx10Q9CWT3 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx10Q9CWT3 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Snx10Q9CWT3 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Snx10Q9CWT3 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx10Q9CWT3 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Snx10Q9CWT3 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Snx10Q9CWT3 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Snx10Q9CWT3 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Snx10Q9CWT3 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx10Q9CWT3 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Snx10Q9CWT3 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx10Q9CWT3 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Snx10Q9CWT3 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Snx10Q9CWT3 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Snx10Q9CWT3 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Snx10Q9CWT3 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Snx10Q9CWT3 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx10Q9CWT3 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Snx10Q9CWT3 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx10Q9CWT3 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx10Q9CWT3 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Snx10Q9CWT3 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Snx10Q9CWT3 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Snx10Q9CWT3 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx10Q9CWT3 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Snx10Q9CWT3 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx10Q9CWT3 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx10Q9CWT3 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx10Q9CWT3 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Snx10Q9CWT3 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx10Q9CWT3 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx10Q9CWT3 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Snx10Q9CWT3 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx10Q9CWT3 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Snx10Q9CWT3 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Snx10Q9CWT3 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Snx10Q9CWT3 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Snx10Q9CWT3 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Snx10Q9CWT3 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Snx10Q9CWT3 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Snx10Q9CWT3 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Snx10Q9CWT3 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snx10Q9CWT3 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snx10Q9CWT3 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Snx10Q9CWT3 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Snx10Q9CWT3 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snx10Q9CWT3 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms