Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTH6

Fcf1, rRNA-processing protein FCF1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcf1Q9CTH6 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Fcf1Q9CTH6 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Fcf1Q9CTH6 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Fcf1Q9CTH6 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Fcf1Q9CTH6 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Fcf1Q9CTH6 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Fcf1Q9CTH6 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Fcf1Q9CTH6 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Fcf1Q9CTH6 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Fcf1Q9CTH6 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Fcf1Q9CTH6 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Fcf1Q9CTH6 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Fcf1Q9CTH6 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Fcf1Q9CTH6 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Fcf1Q9CTH6 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Fcf1Q9CTH6 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Fcf1Q9CTH6 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Fcf1Q9CTH6 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Fcf1Q9CTH6 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Fcf1Q9CTH6 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Fcf1Q9CTH6 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Fcf1Q9CTH6 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Fcf1Q9CTH6 Gm13780-201ENSMUST00000150482 1187 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Fcf1Q9CTH6 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Fcf1Q9CTH6 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Fcf1Q9CTH6 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Fcf1Q9CTH6 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Fcf1Q9CTH6 Gm45574-201ENSMUST00000210921 331 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Fcf1Q9CTH6 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Fcf1Q9CTH6 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Fcf1Q9CTH6 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Fcf1Q9CTH6 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Fcf1Q9CTH6 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Fcf1Q9CTH6 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Fcf1Q9CTH6 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Fcf1Q9CTH6 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Fcf1Q9CTH6 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Fcf1Q9CTH6 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Fcf1Q9CTH6 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Fcf1Q9CTH6 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Fcf1Q9CTH6 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Fcf1Q9CTH6 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Fcf1Q9CTH6 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Fcf1Q9CTH6 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Fcf1Q9CTH6 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Fcf1Q9CTH6 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Fcf1Q9CTH6 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Fcf1Q9CTH6 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Fcf1Q9CTH6 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Fcf1Q9CTH6 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Fcf1Q9CTH6 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Fcf1Q9CTH6 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Fcf1Q9CTH6 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Fcf1Q9CTH6 Gnat3-201ENSMUST00000030561 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Fcf1Q9CTH6 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Fcf1Q9CTH6 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Fcf1Q9CTH6 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Fcf1Q9CTH6 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Fcf1Q9CTH6 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Fcf1Q9CTH6 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Fcf1Q9CTH6 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Fcf1Q9CTH6 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Fcf1Q9CTH6 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Fcf1Q9CTH6 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Fcf1Q9CTH6 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Fcf1Q9CTH6 2810403D21Rik-207ENSMUST00000152089 852 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Fcf1Q9CTH6 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Fcf1Q9CTH6 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Fcf1Q9CTH6 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Fcf1Q9CTH6 Gm43275-201ENSMUST00000202053 1020 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Fcf1Q9CTH6 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Fcf1Q9CTH6 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Fcf1Q9CTH6 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Fcf1Q9CTH6 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Fcf1Q9CTH6 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Fcf1Q9CTH6 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Fcf1Q9CTH6 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Fcf1Q9CTH6 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Fcf1Q9CTH6 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Fcf1Q9CTH6 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Fcf1Q9CTH6 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Fcf1Q9CTH6 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Fcf1Q9CTH6 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Fcf1Q9CTH6 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Fcf1Q9CTH6 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Fcf1Q9CTH6 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Fcf1Q9CTH6 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Fcf1Q9CTH6 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Fcf1Q9CTH6 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Fcf1Q9CTH6 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Fcf1Q9CTH6 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Fcf1Q9CTH6 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Fcf1Q9CTH6 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Fcf1Q9CTH6 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Fcf1Q9CTH6 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Fcf1Q9CTH6 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Fcf1Q9CTH6 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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