Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSV6

Sft2d3, Vesicle transport protein SFT2C, mousemouse

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Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d3Q9CSV6 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sft2d3Q9CSV6 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sft2d3Q9CSV6 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sft2d3Q9CSV6 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sft2d3Q9CSV6 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sft2d3Q9CSV6 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Sft2d3Q9CSV6 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sft2d3Q9CSV6 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sft2d3Q9CSV6 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sft2d3Q9CSV6 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sft2d3Q9CSV6 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sft2d3Q9CSV6 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sft2d3Q9CSV6 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sft2d3Q9CSV6 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sft2d3Q9CSV6 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sft2d3Q9CSV6 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Sft2d3Q9CSV6 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sft2d3Q9CSV6 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sft2d3Q9CSV6 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sft2d3Q9CSV6 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sft2d3Q9CSV6 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sft2d3Q9CSV6 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sft2d3Q9CSV6 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sft2d3Q9CSV6 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sft2d3Q9CSV6 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sft2d3Q9CSV6 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sft2d3Q9CSV6 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sft2d3Q9CSV6 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sft2d3Q9CSV6 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sft2d3Q9CSV6 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sft2d3Q9CSV6 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sft2d3Q9CSV6 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sft2d3Q9CSV6 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Sft2d3Q9CSV6 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sft2d3Q9CSV6 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Sft2d3Q9CSV6 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sft2d3Q9CSV6 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sft2d3Q9CSV6 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Sft2d3Q9CSV6 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sft2d3Q9CSV6 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sft2d3Q9CSV6 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sft2d3Q9CSV6 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Sft2d3Q9CSV6 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Sft2d3Q9CSV6 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sft2d3Q9CSV6 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sft2d3Q9CSV6 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sft2d3Q9CSV6 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sft2d3Q9CSV6 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sft2d3Q9CSV6 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sft2d3Q9CSV6 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Sft2d3Q9CSV6 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sft2d3Q9CSV6 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sft2d3Q9CSV6 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sft2d3Q9CSV6 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sft2d3Q9CSV6 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sft2d3Q9CSV6 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Sft2d3Q9CSV6 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Sft2d3Q9CSV6 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Sft2d3Q9CSV6 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Sft2d3Q9CSV6 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sft2d3Q9CSV6 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Sft2d3Q9CSV6 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sft2d3Q9CSV6 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Sft2d3Q9CSV6 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sft2d3Q9CSV6 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sft2d3Q9CSV6 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sft2d3Q9CSV6 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
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Sft2d3Q9CSV6 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Sft2d3Q9CSV6 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Sft2d3Q9CSV6 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Sft2d3Q9CSV6 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sft2d3Q9CSV6 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sft2d3Q9CSV6 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sft2d3Q9CSV6 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sft2d3Q9CSV6 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sft2d3Q9CSV6 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sft2d3Q9CSV6 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sft2d3Q9CSV6 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sft2d3Q9CSV6 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sft2d3Q9CSV6 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sft2d3Q9CSV6 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sft2d3Q9CSV6 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sft2d3Q9CSV6 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sft2d3Q9CSV6 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Sft2d3Q9CSV6 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Sft2d3Q9CSV6 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Sft2d3Q9CSV6 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Sft2d3Q9CSV6 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
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