Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ0

Smim8, Small integral membrane protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim8Q9CQQ0 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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