Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL6

Mrpl35, 39S ribosomal protein L35, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl35Q9CQL6 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Mrpl35Q9CQL6 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Mrpl35Q9CQL6 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Mrpl35Q9CQL6 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Mrpl35Q9CQL6 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Mrpl35Q9CQL6 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Mrpl35Q9CQL6 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Mrpl35Q9CQL6 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Mrpl35Q9CQL6 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Mrpl35Q9CQL6 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Mrpl35Q9CQL6 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Mrpl35Q9CQL6 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Mrpl35Q9CQL6 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Mrpl35Q9CQL6 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Mrpl35Q9CQL6 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Mrpl35Q9CQL6 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Mrpl35Q9CQL6 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Mrpl35Q9CQL6 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Mrpl35Q9CQL6 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Mrpl35Q9CQL6 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Mrpl35Q9CQL6 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Mrpl35Q9CQL6 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Mrpl35Q9CQL6 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Mrpl35Q9CQL6 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Mrpl35Q9CQL6 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Mrpl35Q9CQL6 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Mrpl35Q9CQL6 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Mrpl35Q9CQL6 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Mrpl35Q9CQL6 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Mrpl35Q9CQL6 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Mrpl35Q9CQL6 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Mrpl35Q9CQL6 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Mrpl35Q9CQL6 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Mrpl35Q9CQL6 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Mrpl35Q9CQL6 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Mrpl35Q9CQL6 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Mrpl35Q9CQL6 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Mrpl35Q9CQL6 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Mrpl35Q9CQL6 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Mrpl35Q9CQL6 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Mrpl35Q9CQL6 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Mrpl35Q9CQL6 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Mrpl35Q9CQL6 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Mrpl35Q9CQL6 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Mrpl35Q9CQL6 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Mrpl35Q9CQL6 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Mrpl35Q9CQL6 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Mrpl35Q9CQL6 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Mrpl35Q9CQL6 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Mrpl35Q9CQL6 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Mrpl35Q9CQL6 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Mrpl35Q9CQL6 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Mrpl35Q9CQL6 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Mrpl35Q9CQL6 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Mrpl35Q9CQL6 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Mrpl35Q9CQL6 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Mrpl35Q9CQL6 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl35Q9CQL6 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl35Q9CQL6 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl35Q9CQL6 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl35Q9CQL6 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl35Q9CQL6 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl35Q9CQL6 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl35Q9CQL6 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl35Q9CQL6 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl35Q9CQL6 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl35Q9CQL6 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl35Q9CQL6 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl35Q9CQL6 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl35Q9CQL6 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl35Q9CQL6 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Mrpl35Q9CQL6 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl35Q9CQL6 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl35Q9CQL6 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl35Q9CQL6 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl35Q9CQL6 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl35Q9CQL6 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl35Q9CQL6 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl35Q9CQL6 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl35Q9CQL6 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl35Q9CQL6 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl35Q9CQL6 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl35Q9CQL6 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl35Q9CQL6 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl35Q9CQL6 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl35Q9CQL6 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl35Q9CQL6 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl35Q9CQL6 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl35Q9CQL6 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl35Q9CQL6 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl35Q9CQL6 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl35Q9CQL6 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl35Q9CQL6 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl35Q9CQL6 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl35Q9CQL6 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl35Q9CQL6 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl35Q9CQL6 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl35Q9CQL6 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl35Q9CQL6 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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