Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQH0

Pdzk1ip1, PDZK1-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.8 ms