Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD8

Atp6v0e1, V-type proton ATPase subunit e 1, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6v0e1Q9CQD8 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Atp6v0e1Q9CQD8 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 164 ms