Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ68

1700029P11Rik, RIKEN cDNA 1700029P11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700029P11RikQ9CQ68 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.5 ms