Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPS8

Small membrane A-kinase anchor protein, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CPS8 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q9CPS8 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q9CPS8 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q9CPS8 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q9CPS8 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q9CPS8 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q9CPS8 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Q9CPS8 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Q9CPS8 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Q9CPS8 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q9CPS8 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q9CPS8 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q9CPS8 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q9CPS8 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q9CPS8 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q9CPS8 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q9CPS8 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q9CPS8 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q9CPS8 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q9CPS8 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q9CPS8 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q9CPS8 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q9CPS8 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q9CPS8 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q9CPS8 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q9CPS8 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q9CPS8 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q9CPS8 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q9CPS8 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q9CPS8 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q9CPS8 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q9CPS8 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q9CPS8 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q9CPS8 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q9CPS8 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q9CPS8 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q9CPS8 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q9CPS8 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q9CPS8 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q9CPS8 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Q9CPS8 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q9CPS8 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q9CPS8 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q9CPS8 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q9CPS8 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Q9CPS8 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q9CPS8 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q9CPS8 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q9CPS8 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q9CPS8 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Q9CPS8 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q9CPS8 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q9CPS8 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Q9CPS8 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Q9CPS8 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Q9CPS8 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Q9CPS8 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Q9CPS8 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Q9CPS8 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Q9CPS8 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Q9CPS8 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Q9CPS8 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Q9CPS8 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q9CPS8 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q9CPS8 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q9CPS8 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q9CPS8 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q9CPS8 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q9CPS8 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q9CPS8 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Q9CPS8 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q9CPS8 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q9CPS8 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q9CPS8 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q9CPS8 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q9CPS8 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q9CPS8 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Q9CPS8 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q9CPS8 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q9CPS8 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q9CPS8 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q9CPS8 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q9CPS8 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q9CPS8 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Q9CPS8 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q9CPS8 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q9CPS8 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q9CPS8 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q9CPS8 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q9CPS8 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q9CPS8 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q9CPS8 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q9CPS8 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q9CPS8 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q9CPS8 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q9CPS8 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q9CPS8 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q9CPS8 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q9CPS8 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q9CPS8 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms