Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV0

Prpf8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf8Q99PV0 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Prpf8Q99PV0 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms