Protein–RNA interactions for Protein: Q99P91

Gpnmb, Transmembrane glycoprotein NMB, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GpnmbQ99P91 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
GpnmbQ99P91 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
GpnmbQ99P91 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
GpnmbQ99P91 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
GpnmbQ99P91 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
GpnmbQ99P91 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
GpnmbQ99P91 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
GpnmbQ99P91 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
GpnmbQ99P91 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
GpnmbQ99P91 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
GpnmbQ99P91 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
GpnmbQ99P91 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
GpnmbQ99P91 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
GpnmbQ99P91 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
GpnmbQ99P91 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
GpnmbQ99P91 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
GpnmbQ99P91 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
GpnmbQ99P91 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
GpnmbQ99P91 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
GpnmbQ99P91 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
GpnmbQ99P91 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
GpnmbQ99P91 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
GpnmbQ99P91 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
GpnmbQ99P91 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
GpnmbQ99P91 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
GpnmbQ99P91 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
GpnmbQ99P91 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
GpnmbQ99P91 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
GpnmbQ99P91 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
GpnmbQ99P91 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
GpnmbQ99P91 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
GpnmbQ99P91 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
GpnmbQ99P91 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
GpnmbQ99P91 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
GpnmbQ99P91 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
GpnmbQ99P91 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
GpnmbQ99P91 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
GpnmbQ99P91 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
GpnmbQ99P91 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
GpnmbQ99P91 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
GpnmbQ99P91 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
GpnmbQ99P91 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
GpnmbQ99P91 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
GpnmbQ99P91 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
GpnmbQ99P91 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
GpnmbQ99P91 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
GpnmbQ99P91 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
GpnmbQ99P91 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
GpnmbQ99P91 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
GpnmbQ99P91 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
GpnmbQ99P91 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
GpnmbQ99P91 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
GpnmbQ99P91 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
GpnmbQ99P91 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
GpnmbQ99P91 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
GpnmbQ99P91 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
GpnmbQ99P91 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
GpnmbQ99P91 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
GpnmbQ99P91 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
GpnmbQ99P91 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
GpnmbQ99P91 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
GpnmbQ99P91 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
GpnmbQ99P91 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
GpnmbQ99P91 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
GpnmbQ99P91 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
GpnmbQ99P91 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
GpnmbQ99P91 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
GpnmbQ99P91 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
GpnmbQ99P91 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
GpnmbQ99P91 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
GpnmbQ99P91 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
GpnmbQ99P91 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
GpnmbQ99P91 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
GpnmbQ99P91 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
GpnmbQ99P91 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
GpnmbQ99P91 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
GpnmbQ99P91 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
GpnmbQ99P91 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
GpnmbQ99P91 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
GpnmbQ99P91 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
GpnmbQ99P91 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
GpnmbQ99P91 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
GpnmbQ99P91 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
GpnmbQ99P91 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
GpnmbQ99P91 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
GpnmbQ99P91 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
GpnmbQ99P91 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
GpnmbQ99P91 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
GpnmbQ99P91 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
GpnmbQ99P91 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
GpnmbQ99P91 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
GpnmbQ99P91 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
GpnmbQ99P91 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
GpnmbQ99P91 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
GpnmbQ99P91 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
GpnmbQ99P91 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
GpnmbQ99P91 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
GpnmbQ99P91 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
GpnmbQ99P91 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
GpnmbQ99P91 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms