Protein–RNA interactions for Protein: Q99P51

Rassf3, Ras association domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rassf3Q99P51 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rassf3Q99P51 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rassf3Q99P51 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rassf3Q99P51 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rassf3Q99P51 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Rassf3Q99P51 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rassf3Q99P51 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rassf3Q99P51 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rassf3Q99P51 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rassf3Q99P51 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rassf3Q99P51 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Rassf3Q99P51 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rassf3Q99P51 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Rassf3Q99P51 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Rassf3Q99P51 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Rassf3Q99P51 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Rassf3Q99P51 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Rassf3Q99P51 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rassf3Q99P51 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rassf3Q99P51 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Rassf3Q99P51 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Rassf3Q99P51 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Rassf3Q99P51 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Rassf3Q99P51 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Rassf3Q99P51 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rassf3Q99P51 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rassf3Q99P51 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rassf3Q99P51 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rassf3Q99P51 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rassf3Q99P51 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rassf3Q99P51 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rassf3Q99P51 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rassf3Q99P51 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rassf3Q99P51 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rassf3Q99P51 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rassf3Q99P51 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rassf3Q99P51 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rassf3Q99P51 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rassf3Q99P51 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rassf3Q99P51 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rassf3Q99P51 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rassf3Q99P51 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rassf3Q99P51 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rassf3Q99P51 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rassf3Q99P51 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rassf3Q99P51 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rassf3Q99P51 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rassf3Q99P51 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rassf3Q99P51 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rassf3Q99P51 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rassf3Q99P51 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rassf3Q99P51 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rassf3Q99P51 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rassf3Q99P51 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rassf3Q99P51 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rassf3Q99P51 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rassf3Q99P51 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rassf3Q99P51 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rassf3Q99P51 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rassf3Q99P51 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Rassf3Q99P51 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rassf3Q99P51 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Rassf3Q99P51 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Rassf3Q99P51 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Rassf3Q99P51 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Rassf3Q99P51 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rassf3Q99P51 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rassf3Q99P51 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rassf3Q99P51 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rassf3Q99P51 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rassf3Q99P51 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rassf3Q99P51 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rassf3Q99P51 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rassf3Q99P51 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rassf3Q99P51 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rassf3Q99P51 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rassf3Q99P51 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rassf3Q99P51 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rassf3Q99P51 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rassf3Q99P51 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rassf3Q99P51 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rassf3Q99P51 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rassf3Q99P51 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rassf3Q99P51 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rassf3Q99P51 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rassf3Q99P51 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rassf3Q99P51 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rassf3Q99P51 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rassf3Q99P51 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rassf3Q99P51 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rassf3Q99P51 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rassf3Q99P51 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rassf3Q99P51 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rassf3Q99P51 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rassf3Q99P51 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rassf3Q99P51 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rassf3Q99P51 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rassf3Q99P51 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rassf3Q99P51 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rassf3Q99P51 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.4 ms