Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV1

Tdrd1, Tudor domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd1Q99MV1 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tdrd1Q99MV1 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tdrd1Q99MV1 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tdrd1Q99MV1 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tdrd1Q99MV1 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tdrd1Q99MV1 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tdrd1Q99MV1 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tdrd1Q99MV1 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tdrd1Q99MV1 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tdrd1Q99MV1 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tdrd1Q99MV1 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tdrd1Q99MV1 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tdrd1Q99MV1 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tdrd1Q99MV1 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tdrd1Q99MV1 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tdrd1Q99MV1 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tdrd1Q99MV1 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tdrd1Q99MV1 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tdrd1Q99MV1 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tdrd1Q99MV1 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tdrd1Q99MV1 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tdrd1Q99MV1 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tdrd1Q99MV1 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tdrd1Q99MV1 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tdrd1Q99MV1 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tdrd1Q99MV1 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tdrd1Q99MV1 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tdrd1Q99MV1 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tdrd1Q99MV1 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tdrd1Q99MV1 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tdrd1Q99MV1 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tdrd1Q99MV1 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tdrd1Q99MV1 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tdrd1Q99MV1 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tdrd1Q99MV1 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tdrd1Q99MV1 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tdrd1Q99MV1 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tdrd1Q99MV1 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tdrd1Q99MV1 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tdrd1Q99MV1 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tdrd1Q99MV1 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tdrd1Q99MV1 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tdrd1Q99MV1 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tdrd1Q99MV1 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tdrd1Q99MV1 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tdrd1Q99MV1 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tdrd1Q99MV1 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tdrd1Q99MV1 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tdrd1Q99MV1 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tdrd1Q99MV1 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tdrd1Q99MV1 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tdrd1Q99MV1 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tdrd1Q99MV1 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tdrd1Q99MV1 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tdrd1Q99MV1 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tdrd1Q99MV1 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tdrd1Q99MV1 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tdrd1Q99MV1 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tdrd1Q99MV1 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tdrd1Q99MV1 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tdrd1Q99MV1 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tdrd1Q99MV1 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tdrd1Q99MV1 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tdrd1Q99MV1 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tdrd1Q99MV1 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tdrd1Q99MV1 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tdrd1Q99MV1 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tdrd1Q99MV1 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tdrd1Q99MV1 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tdrd1Q99MV1 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tdrd1Q99MV1 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tdrd1Q99MV1 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tdrd1Q99MV1 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tdrd1Q99MV1 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tdrd1Q99MV1 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tdrd1Q99MV1 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tdrd1Q99MV1 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tdrd1Q99MV1 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tdrd1Q99MV1 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tdrd1Q99MV1 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tdrd1Q99MV1 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tdrd1Q99MV1 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tdrd1Q99MV1 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tdrd1Q99MV1 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tdrd1Q99MV1 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tdrd1Q99MV1 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tdrd1Q99MV1 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tdrd1Q99MV1 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tdrd1Q99MV1 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tdrd1Q99MV1 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tdrd1Q99MV1 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tdrd1Q99MV1 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tdrd1Q99MV1 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tdrd1Q99MV1 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tdrd1Q99MV1 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tdrd1Q99MV1 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tdrd1Q99MV1 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tdrd1Q99MV1 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tdrd1Q99MV1 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tdrd1Q99MV1 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms