Protein–RNA interactions for Protein: Q99L48

Nmd3, 60S ribosomal export protein NMD3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nmd3Q99L48 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nmd3Q99L48 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nmd3Q99L48 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nmd3Q99L48 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nmd3Q99L48 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nmd3Q99L48 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nmd3Q99L48 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nmd3Q99L48 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nmd3Q99L48 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nmd3Q99L48 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nmd3Q99L48 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nmd3Q99L48 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nmd3Q99L48 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nmd3Q99L48 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nmd3Q99L48 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nmd3Q99L48 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nmd3Q99L48 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nmd3Q99L48 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nmd3Q99L48 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nmd3Q99L48 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nmd3Q99L48 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nmd3Q99L48 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nmd3Q99L48 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nmd3Q99L48 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nmd3Q99L48 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nmd3Q99L48 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nmd3Q99L48 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nmd3Q99L48 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nmd3Q99L48 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nmd3Q99L48 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nmd3Q99L48 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nmd3Q99L48 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Nmd3Q99L48 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nmd3Q99L48 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nmd3Q99L48 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nmd3Q99L48 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nmd3Q99L48 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Nmd3Q99L48 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nmd3Q99L48 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nmd3Q99L48 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nmd3Q99L48 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nmd3Q99L48 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nmd3Q99L48 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nmd3Q99L48 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nmd3Q99L48 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nmd3Q99L48 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nmd3Q99L48 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nmd3Q99L48 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nmd3Q99L48 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nmd3Q99L48 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nmd3Q99L48 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nmd3Q99L48 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nmd3Q99L48 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nmd3Q99L48 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nmd3Q99L48 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nmd3Q99L48 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nmd3Q99L48 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nmd3Q99L48 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nmd3Q99L48 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nmd3Q99L48 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nmd3Q99L48 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nmd3Q99L48 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nmd3Q99L48 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Nmd3Q99L48 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nmd3Q99L48 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nmd3Q99L48 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nmd3Q99L48 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nmd3Q99L48 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nmd3Q99L48 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nmd3Q99L48 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nmd3Q99L48 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nmd3Q99L48 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nmd3Q99L48 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nmd3Q99L48 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Nmd3Q99L48 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nmd3Q99L48 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nmd3Q99L48 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Nmd3Q99L48 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nmd3Q99L48 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nmd3Q99L48 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nmd3Q99L48 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nmd3Q99L48 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nmd3Q99L48 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nmd3Q99L48 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nmd3Q99L48 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nmd3Q99L48 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nmd3Q99L48 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nmd3Q99L48 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nmd3Q99L48 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nmd3Q99L48 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nmd3Q99L48 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nmd3Q99L48 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nmd3Q99L48 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nmd3Q99L48 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nmd3Q99L48 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nmd3Q99L48 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nmd3Q99L48 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nmd3Q99L48 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nmd3Q99L48 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nmd3Q99L48 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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