Protein–RNA interactions for Protein: Q99L02

Pagr1a, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1aQ99L02 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pagr1aQ99L02 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pagr1aQ99L02 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pagr1aQ99L02 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pagr1aQ99L02 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pagr1aQ99L02 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pagr1aQ99L02 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pagr1aQ99L02 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pagr1aQ99L02 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pagr1aQ99L02 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pagr1aQ99L02 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pagr1aQ99L02 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pagr1aQ99L02 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pagr1aQ99L02 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pagr1aQ99L02 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pagr1aQ99L02 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pagr1aQ99L02 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pagr1aQ99L02 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pagr1aQ99L02 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pagr1aQ99L02 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pagr1aQ99L02 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pagr1aQ99L02 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pagr1aQ99L02 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pagr1aQ99L02 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pagr1aQ99L02 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pagr1aQ99L02 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pagr1aQ99L02 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Pagr1aQ99L02 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pagr1aQ99L02 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Pagr1aQ99L02 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pagr1aQ99L02 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Pagr1aQ99L02 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pagr1aQ99L02 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pagr1aQ99L02 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Pagr1aQ99L02 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Pagr1aQ99L02 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pagr1aQ99L02 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Pagr1aQ99L02 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pagr1aQ99L02 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pagr1aQ99L02 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pagr1aQ99L02 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Pagr1aQ99L02 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pagr1aQ99L02 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pagr1aQ99L02 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pagr1aQ99L02 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pagr1aQ99L02 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pagr1aQ99L02 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pagr1aQ99L02 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pagr1aQ99L02 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pagr1aQ99L02 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pagr1aQ99L02 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pagr1aQ99L02 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pagr1aQ99L02 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pagr1aQ99L02 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pagr1aQ99L02 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pagr1aQ99L02 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pagr1aQ99L02 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Pagr1aQ99L02 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Pagr1aQ99L02 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pagr1aQ99L02 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pagr1aQ99L02 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pagr1aQ99L02 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Pagr1aQ99L02 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Pagr1aQ99L02 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Pagr1aQ99L02 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Pagr1aQ99L02 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Pagr1aQ99L02 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pagr1aQ99L02 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pagr1aQ99L02 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pagr1aQ99L02 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pagr1aQ99L02 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pagr1aQ99L02 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pagr1aQ99L02 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pagr1aQ99L02 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pagr1aQ99L02 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pagr1aQ99L02 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pagr1aQ99L02 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pagr1aQ99L02 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pagr1aQ99L02 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pagr1aQ99L02 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pagr1aQ99L02 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pagr1aQ99L02 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Pagr1aQ99L02 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pagr1aQ99L02 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pagr1aQ99L02 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pagr1aQ99L02 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pagr1aQ99L02 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pagr1aQ99L02 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pagr1aQ99L02 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pagr1aQ99L02 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pagr1aQ99L02 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Pagr1aQ99L02 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pagr1aQ99L02 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pagr1aQ99L02 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pagr1aQ99L02 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pagr1aQ99L02 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pagr1aQ99L02 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pagr1aQ99L02 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pagr1aQ99L02 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pagr1aQ99L02 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms