Protein–RNA interactions for Protein: Q99KL7

Rab28, Ras-related protein Rab-28, mousemouse

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Length 221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab28Q99KL7 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rab28Q99KL7 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
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